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Enregistrement W4387375256 · doi:10.1038/s43856-023-00360-3

Precision subclassification of type 2 diabetes: a systematic review

2023· review· en· W4387375256 sur OpenAlexaff
Shivani Misra, Róbert Wágner, Bige Özkan, Martin Schön, Magdalena Sevilla-González, Katsiaryna Prystupa, Caroline C. Wang, Raymond J. Kreienkamp, Sara J. Cromer, Mary R. Rooney, Daisy Duan, Anne Cathrine B. Thuesen, Amelia S. Wallace, Aaron Leong, Aaron J. Deutsch, Mette K. Andersen, Liana K. Billings, Robert H. Eckel, Wayne Huey‐Herng Sheu, Torben Hansen, Norbert Stefan, Mark O. Goodarzi, Debashree Ray, Elizabeth Selvin, José C. Florez, Deirdre K. Tobias, Jordi Merino, Abrar Ahmad, Catherine Aiken, Jamie L. Benham, Dhanasekaran Bodhini, Amy L. Clark, Kevin Colclough, Rosa Corcoy, Jamie L. Felton, Ellen C. Francis, Pieter Gillard, Véronique Gingras, Romy Gaillard, Eram Haider, Alice E. Hughes, Jennifer M. Iklé, Laura M. Jacobsen, Anna R. Kahkoska, Jarno L. T. Kettunen, Lee‐Ling Lim, Jonna M. E. Männistö, Robert Massey, Niamh‐Maire Mclennan, Rachel G. Miller, Mario Luca Morieri, Jasper Most, Rochelle N. Naylor, Kashyap Patel, Scott J. Pilla, Sridaran Raghaven, Zhila Semnani‐Azad, Pernille Svalastoga, Wubet Worku Takele, Claudia H.T. Tam, Mustafa Tosur, Jessie J. Wong, Jennifer M. Yamamoto, Katherine Young, Chloé Amouyal, Maxine P. Bonham, Mingling Chen, Feifei Cheng, Tinashe Chikowore, Sian C. Chivers, Christoffer Clemmensen, Dana Dabelea, Adem Y. Dawed, Laura T. Dickens, Linda A. DiMeglio, Monika Dudenhöffer‐Pfeifer, Carmella Evans‐Molina, María Mercè Fernández-Balsells, Hugo Fitipaldi, Stephanie L. Fitzpatrick, Stephen E. Gitelman, Jessica A. Grieger, Marta Guasch‐Ferré, Nahal Habibi, Chuiguo Huang, Arianna Harris-Kawano, Heba M. Ismail, Benjamin Hoag, Randi K. Johnson, Angus G. Jones, Robert W. Koivula, Gloria K. W. Leung, Ingrid Libman, Kai Liu, S. Alice Long, William L. Lowe, Robert W. Morton, Ayesha A. Motala, Suna Önengüt-Gümüşcü, James S. Pankow, Maleesa Pathirana, Sofia Pazmiño, Dianna Perez, John R. Petrie, Camille E. Powe, Alejandra Quinteros, Rashmi Jain, Mathias Ried‐Larsen, Zeb Saeed, Vanessa Santhakumar, Sarah Kanbour, Sudipa Sarkar, Gabriela S. F. Monaco, Denise Scholtens, Cate Speake, Maggie A. Stanislawski, Nele Steenackers, Andrea K. Steck, Julie Støy, Rachael W. Taylor, Sok Cin Tye, Gebresilasea Gendisha Ukke, Marzhan Urazbayeva, Bart Van der Schueren, Camille Vatier, John M. Wentworth, Wesley Hannah, Sara L. White, Gechang Yu, Yingchai Zhang, Shao J. Zhou, Jacques Beltrand, Michel Polak, Ingvild Aukrust, Elisa De Franco, Sarah E. Flanagan, Kristin A. Maloney, Andrew McGovern, Janne Molnes, Mariam Nakabuye, Pål R. Njølstad, Hugo Pomares‐Millan, Michele Provenzano, Cécile Saint‐Martin, Cuilin Zhang, Yeyi Zhu, Sungyoung Auh, Russell J. de Souza, Andrea J. Fawcett, Chandra Gruber, Eskedar Getie Mekonnen, Emily Mixter, Diana Sherifali, John J. Nolan, Louis H. Philipson, Rebecca J. Brown, Kristen E. Boyle, Tina Costacou, John Dennis, Anna L. Gloyn, Maria F. Gomez, Peter A. Gottlieb, Siri Atma W. Greeley, Kurt Griffin, Andrew T. Hattersley, Irl B. Hirsch, Marie‐France Hivert, Korey K. Hood, Jami L. Josefson, Soo Heon Kwak, Lori M. Laffel, Siew Lim, Ruth J. F. Loos, Ronald C.W., Chantal Mathieu, Nestoras Mathioudakis, Viswanathan Mohan, Rinki Murphy, Richard A. Oram, Katharine R. Owen, Susan E. Ozanne, Ewan R. Pearson, Wei Perng, Toni I. Pollin, Rodica Pop‐Busui, Richard E. Pratley, Leanne M. Redman, María J. Redondo, Rebecca M. Reynolds, Robert K. Semple, Jennifer L. Sherr, Emily K. Sims, Arianne Sweeting, Miriam S. Udler, Kimberly K. Vesco, Tina Vilsbøll, Stephen S. Rich, Paul W. Franks

Notice bibliographique

RevueCommunications Medicine · 2023
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiabetes, Cardiovascular Risks, and Lipoproteins
Établissements canadiensUniversité de MontréalPopulation Health Research InstituteUniversity of ManitobaUniversité de SherbrookeMcMaster UniversityCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineImpactUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteMedical Research CouncilNational Institutes of HealthNovo Nordisk FondenNational Institute of General Medical SciencesNovo NordiskNational Institute for Health and Care ResearchEuropean Association for the Study of DiabetesNovo Nordisk Foundation Center for Basic Metabolic ResearchNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesLunds UniversitetBritish Heart FoundationWellcome TrustAmerican Diabetes AssociationAmerican Heart AssociationPediatric Endocrine Society
Mots-clésType 2 diabetesSystematic reviewMedicineDiabetes mellitusMEDLINEPolitical scienceEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Heterogeneity in type 2 diabetes presentation and progression suggests that precision medicine interventions could improve clinical outcomes. We undertook a systematic review to determine whether strategies to subclassify type 2 diabetes were associated with high quality evidence, reproducible results and improved outcomes for patients. METHODS: We searched PubMed and Embase for publications that used 'simple subclassification' approaches using simple categorisation of clinical characteristics, or 'complex subclassification' approaches which used machine learning or 'omics approaches in people with established type 2 diabetes. We excluded other diabetes subtypes and those predicting incident type 2 diabetes. We assessed quality, reproducibility and clinical relevance of extracted full-text articles and qualitatively synthesised a summary of subclassification approaches. RESULTS: Here we show data from 51 studies that demonstrate many simple stratification approaches, but none have been replicated and many are not associated with meaningful clinical outcomes. Complex stratification was reviewed in 62 studies and produced reproducible subtypes of type 2 diabetes that are associated with outcomes. Both approaches require a higher grade of evidence but support the premise that type 2 diabetes can be subclassified into clinically meaningful subtypes. CONCLUSION: Critical next steps toward clinical implementation are to test whether subtypes exist in more diverse ancestries and whether tailoring interventions to subtypes will improve outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,020
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,083
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,105

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0200,083
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0100,009
Bibliométrie0,0110,010
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,183
Tête enseignante GPT0,414
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations96
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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