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Enregistrement W4387394669 · doi:10.3791/65802

Erosion Identification in Metacarpophalangeal Joints in Rheumatoid Arthritis using High-Resolution Peripheral Quantitative Computed Tomography

2023· article· en· W4387394669 sur OpenAlexafffund
Yousif Al-Khoury, Stephanie Finzel, Camille P. Figueiredo, Andrew J. Burghardt, Kathryn S. Stok, Lai‐Shan Tam, Isaac T Cheng, Justin J. Tse, Sarah L. Manske

Notice bibliographique

RevueJournal of Visualized Experiments · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRheumatoid Arthritis Research and Therapies
Établissements canadiensAlberta Bone and Joint Health InstituteUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchArthritis Society
Mots-clésQuantitative computed tomographyMedicineRheumatoid arthritisRadiologyCortical bonePathologicalFeature (linguistics)PeripheralComputer scienceBiomedical engineeringPathologyInternal medicineBone densityOsteoporosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bone erosions are a pathological feature of several forms of inflammatory arthritis including rheumatoid arthritis (RA). The increased presence and size of erosions are associated with poor outcomes, joint function, and disease progression. High-resolution peripheral quantitative computed tomography (HR-pQCT) provides unparalleled in vivo visualization of bone erosions. However, at this resolution, discontinuities in the cortical shell (cortical breaks) that are associated with normal physiological processes and pathology are also visible. The Study grouP for xtrEme Computed Tomography in Rheumatoid Arthritis previously used a consensus process to develop a definition of pathological erosion in HR-pQCT: a cortical break detected in at least two consecutive slices, in at least two perpendicular planes, non-linear in shape, with underlying trabecular bone loss. However, despite the availability of a consensus definition, erosion identification is a demanding task with challenges in inter-rater variability. The purpose of this work is to introduce a training tool to provide users with guidance on identifying pathological cortical breaks on HR-pQCT images for erosion analysis. The protocol presented here uses a custom-built module (Bone Analysis Module (BAM) - Training), implemented as an extension to an open-source image processing software (3D Slicer). Using this module, users can practice identifying erosions and compare their results to erosions annotated by expert rheumatologists.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,708
Score d'incertitude au seuil0,675

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,420
Écart entre enseignants0,365 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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