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Enregistrement W4387402137 · doi:10.1016/j.esmoop.2023.101876

66P Metabolic regulation of GMP- and MDP-derived macrophages in glioblastoma

2023· article· en· W4387402137 sur OpenAlexaff
Lindsay A. Wilson, Meng-Lin Yu, Sylvain Doré, Daniela F. Quail

Notice bibliographique

RevueESMO Open · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune cells in cancer
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTumor microenvironmentGliomaCancer researchMicrogliaMonocyteDownregulation and upregulationChemistryBiologyPopulationCell cultureCell biologyImmunologyBiochemistryInflammationGeneTumor cellsMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glioblastoma is the most common primary malignancy of the brain, affecting approximately 3 per 100 000 people, with a median overall survival of 15 months. Tumor-associated macrophages comprise up to 30% of the glioblastoma tumor microenvironment (TME) and consist of microglia and monocyte-derived macrophages (MDM). MDM arise from granulocyte-monocyte progenitors (GMP) or monocyte-dendritic cell progenitors (MDP). Our recent work identified a unique macrophage population expressing myeloperoxidase (MPO) and other GMP-associated genes associated with long-term survival in glioblastoma patients. ScRNA-seq analysis suggests that MPO+ macrophages may arise from GMPs and are metabolically distinct from MPO- MDM. Interestingly, adoptive transfer of GMP- versus MDP-derived monocytes into glioma-bearing mice had opposing effects on tumor growth. GMP-lineages specifically delayed tumor growth—aligning with our correlative findings in patients. The role of metabolic changes on the anti-tumor function of MDM of distinct developmental lineages remains unknown. We hypothesize that metabolic differences between GMP- and MDP-derived MDM may shift nutrient partitioning within the TME. Bulk RNA-seq of GMP- and MDP-MDM was performed. To functionally assess metabolic differences between GMP- and MDP-MDM, Seahorse XFe96 analysis as well as metabolite analysis of conditioned media will be performed. Bulk RNA-seq of GMP- and MDP-MDM showed differential expression of many metabolic pathways, notably, a downregulation of the pentose phosphate pathway and aerobic respiration in GMP-MDM compared to MDP-MDM. Furthermore, co-culturing GMP- or MDP-MDM with GL261 glioma cell line suggests GMP-MDM are more phagocytic towards tumor cells. We will perform Seahorse XFe96 analysis and metabolite analysis of the conditioned media from GMP-MDM vs. MDP-MDM to investigate the functional impact of metabolic differences further. Understanding how metabolic differences of MDM derived from different lineages shift nutrient competition in the TME will lead to a better understanding of the roles of macrophages in the TME.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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