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Enregistrement W4387404163 · doi:10.1016/j.jsbmb.2023.106408

Development and validation of a liquid chromatography-tandem mass spectrometry assay to quantify plasma 24(S)-hydroxycholesterol and 27-hydroxycholesterol: A new approach integrating the concept of ion ratio

2023· article· en· W4387404163 sur OpenAlexaff
Daniela Rojas Castro, Sérine Benachenhou, Asma Laroui, Amira Abdourahim Aden, Armita Abolghasemi, Luc Galarneau, Taratibu Janvière Irakoze, Rosalie Plantefève, Sophie Bouhour, Amanda Toupin, François Corbin, Guy D. Fink, Pierre‐Luc Mallet, Artuela Çaku

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCholesterol and Lipid Metabolism
Établissements canadiensMcGill University Health CentreUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChromatographyMass spectrometryChemistryTandem mass spectrometryLiquid chromatography–mass spectrometryIon suppression in liquid chromatography–mass spectrometryTandemResolution (logic)Materials scienceComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Accurate quantification of 24(S)-hydroxycholesterol and 27-hydroxycholesterol holds substantial biological significance due to their involvement in pivotal cellular processes, encompassing cholesterol homeostasis, inflammatory responses, neuronal signaling, and their potential as disease biomarkers. The plasma determination of these oxysterols is challenging considering their low concentrations and similarities in terms of empirical formulae, molecular structure, and physicochemical properties across all human endogenous plasma oxysterols. To overcome these sensitivity and specificity issues, we developed and validated a quantification method using liquid chromatography coupled to a tandem mass spectrometry instrument. Validation studies were designed inspired by Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) C62-A Guidelines. The linearity ranged between 20 and 300 nM for both oxysterols with limits of quantification at 20 nM and 30 nM for 24(S)-OHC and 27-OHC, respectively. Inter-day precision coefficient variations (CV) were lower than 10% for both oxysterols. An optimal separation of 25-OHC was obtained from 24(S)-OHC and 27-OHC with a resolution (Rs) > 1.25. The determination and validation of ion ratios for 24(S)-OHC and 27-OHC enabled another quality check in identifying interferents that could impact the quantification. Our developed and validated LC-MS/MS method allows consistent and reliable quantification of human plasmatic 24(S)-OHC and 27-OHC that is warranted in fundamental and clinical research projects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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