Transcriptional Dysregulation and Impaired Neuronal Activity in FMR1 Knock-Out and Fragile X Patients’ iPSC-Derived Models
Notice bibliographique
Résumé
Fragile X syndrome (FXS) is caused by a repression of the FMR1 gene that codes the Fragile X mental retardation protein (FMRP), an RNA binding protein involved in processes that are crucial for proper brain development. To better understand the consequences of the absence of FMRP, we analyzed gene expression profiles and activities of cortical neural progenitor cells (NPCs) and neurons obtained from FXS patients’ induced pluripotent stem cells (IPSCs) and IPSC-derived cells from FMR1 knock-out engineered using CRISPR-CAS9 technology. Multielectrode array recordings revealed in FMR1 KO and FXS patient cells, decreased mean firing rates; activities blocked by tetrodotoxin application. Increased expression of presynaptic mRNA and transcription factors involved in the forebrain specification and decreased levels of mRNA coding AMPA and NMDA subunits were observed using RNA sequencing on FMR1 KO neurons and validated using quantitative PCR in both models. Intriguingly, 40% of the differentially expressed genes were commonly deregulated between NPCs and differentiating neurons with significant enrichments in FMRP targets and autism-related genes found amongst downregulated genes. Our findings suggest that the absence of FMRP affects transcriptional profiles since the NPC stage, and leads to impaired activity and neuronal differentiation over time, which illustrates the critical role of FMRP protein in neuronal development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».