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Enregistrement W4387408679 · doi:10.1007/s13199-023-00939-3

Metabolic and genetic responses to simulated overwintering conditions of alfalfa-rhizobia associations contrasted in their freezing tolerance

2023· article· en· W4387408679 sur OpenAlexafffund
Emmanuelle D’Amours, Annick Bertrand, Jean Cloutier, Annie Claessens, Solen Rocher, Philippe Séguin

Notice bibliographique

RevueSymbiosis · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensMcGill UniversityAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les Technologies
Mots-clésRaffinoseBiologyRhizobiaOverwinteringPerennial plantAcclimatizationBotanyStachyoseFreezing toleranceSymbiosisBacteriaGeneticsGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The study of winter stress tolerance in perennial legumes needs to consider the complete symbiotic system including both plants and bacteria since these two partners are differentially affected by stress conditions. Here, we compared the regrowth after a freezing stress of four different associations of two alfalfa populations differing in freezing tolerance (A-TF0 and A-TF7) inoculated with two Sinorhizobium (Ensifer) meliloti strains (B399 and NRG34) of contrasted adaptation to cold. To understand the contribution of each partner to a better regrowth performance of an association after freezing, we identified molecular traits having major roles in cold acclimation, freezing tolerance, and those involved in the crosstalk between alfalfa and its symbiotic partner. Regrowth after exposure to a freezing stress was 35% larger in the A-TF7 × NRG34 than in the A-TF0 × B399 association. The metabolomic study of roots, crowns and, more specifically, nodules, revealed profound changes in these organs, switching from a sink to support cold acclimation to a source of reserves enabling regrowth after deacclimation. Marked increases in concentrations of stachyose and raffinose, two sugars of the raffinose-family oligosaccharides (RFO), and in the expression level of a gene of the RFO synthetic pathway were observed in response to cold acclimation supporting the importance of a protective role for RFO in alfalfa. Both cold-adapted partners of the symbiotic association contributed to increases in arginine concentration in nodules in response to cold acclimation and deacclimation underscoring the importance of N storage and remobilization for a successful overwintering in alfalfa.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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