In silico investigations on the repurposing of antivirals for Covid-19 and pharmacophore modelling
Notice bibliographique
Résumé
The pandemic COVID-19 has been spreading around the globe from December 2019 onwards and is considered the most infectious disease of this century. To date, there is no effective drug against SARS-CoV-2 discovered by pharmaceutical scientists, and the research is going rigorously all over the world. In this work, we examined the interaction of the already existing antivirals (Lopinavir, Atazanavir, and Remdesivir) with the structural proteins of SARS-CoV-2 using computational methods. Pharmacophore modeling of these drugs was conducted using molecular databases to determine the lead compounds from molecular databases. Pharmagist Webserver and Zinc Molecular Database were used to find out the pharmacophore and lead compounds, respectively. The drug-likeness properties of the compounds were evaluated by the SwissADME webserver. In silico studies showed that the binding affinities of the drugs followed the order Remdesivir > Atazanavir > Lopinavir. Docking and pharmacological studies revealed the potency and drug-likeness of the synthetic molecules.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».