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Enregistrement W4387421031 · doi:10.1111/jeu.13003

<i>Kaonashia insperata</i> gen. et sp. nov., a eukaryotrophic flagellate, represents a novel major lineage of heterotrophic stramenopiles

2023· article· en· W4387421031 sur OpenAlexafffund
E. J. Weston, Yana Eglit, Alastair G. B. Simpson

Notice bibliographique

RevueJournal of Eukaryotic Microbiology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtist diversity and phylogeny
Établissements canadiensUniversity of VictoriaDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyFlagellateProtistEukaryoteLineage (genetic)CladeTestate amoebaePhylogenetic treeFlagellumZoologyPhylogeneticsAlgaeEvolutionary biologyEcologyBotanyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Eukaryotrophic protists are ecologically significant and possess characteristics key to understanding the evolution of eukaryotes; however, they remain poorly studied, due partly to the complexities of maintaining predator–prey cultures. Kaonashia insperata, gen. nov., et sp. nov., is a free‐swimming biflagellated eukaryotroph with a conspicuous ventral groove, a trait observed in distantly related lineages across eukaryote diversity. Di‐eukaryotic (predator–prey) cultures of K. insperata with three marine algae (Isochrysis galbana, Guillardia theta, and Phaeodactylum tricornutum) were established by single‐cell isolation. Growth trials showed that the studied K. insperata clone grew particularly well on G. theta, reaching a peak abundance of 1.0 × 105 ± 4.0 × 104 cells ml−1. Small‐subunit ribosomal DNA phylogenies infer that K. insperata is a stramenopile with moderate support; however, it does not fall within any well‐defined phylogenetic group, including environmental sequence clades (e.g. MASTs), and its specific placement remains unresolved. Electron microscopy shows traits consistent with stramenopile affinity, including mastigonemes on the anterior flagellum and tubular mitochondrial cristae. Kaonashia insperata may represent a novel major lineage within stramenopiles, and be important for understanding the evolutionary history of the group. While heterotrophic stramenopile flagellates are considered to be predominantly bacterivorous, eukaryotrophy may be relatively widespread amongst this assemblage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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