Persistent Acetylation of Histone H3 Lysine 56 Compromises the Activity of DNA Replication Origins
Notice bibliographique
Résumé
In Saccharomyces cerevisiae, newly synthesized histones H3 are acetylated on lysine 56 (H3 K56ac) by the Rtt109 acetyltransferase prior to their deposition on nascent DNA behind replication forks.Two deacetylases of the sirtuin family, Hst3 and Hst4, remove H3 K56ac from chromatin after S phase.hst3D hst4D cells present constitutive H3 K56ac, which sensitizes cells to replicative stress via unclear mechanisms.A chemogenomic screen revealed that DBF4 heterozygosity sensitizes cells to NAM-induced inhibition of sirtuins.DBF4 and CDC7 encode subunits of the Dbf4-dependent kinase (DDK), which activates origins of DNA replication during S phase.We show that (i) cells harboring the dbf4-1 or cdc7-4 hypomorphic alleles are sensitized to NAM, and that (ii) the sirtuins Sir2, Hst1, Hst3, and Hst4 promote DNA replication in cdc7-4 cells.We further demonstrate that Rif1, an inhibitor of DDKdependent activation of origins, causes DNA damage and replication defects in NAM-treated cells and hst3D hst4D mutants.cdc7-4 hst3D hst4D cells are shown to display delayed initiation of DNA replication, which is not due to intra-S checkpoint activation but requires Rtt109-dependent H3 K56ac.Our results suggest that constitutive H3 K56ac sensitizes cells to replicative stress in part by negatively influencing the activation of origins of DNA replication.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».