<scp>ISMRM</scp> Open Science Initiative for Perfusion Imaging (OSIPI): <scp>ASL</scp> pipeline inventory
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: To create an inventory of image processing pipelines of arterial spin labeling (ASL) and list their main features, and to evaluate the capability, flexibility, and ease of use of publicly available pipelines to guide novice ASL users in selecting their optimal pipeline. METHODS: Developers self-assessed their pipelines using a questionnaire developed by the Task Force 1.1 of the ISMRM Open Science Initiative for Perfusion Imaging. Additionally, each publicly available pipeline was evaluated by two independent testers with basic ASL experience using a scoring system created for this purpose. RESULTS: The developers of 21 pipelines filled the questionnaire. Most pipelines are free for noncommercial use (n = 18) and work with the standard NIfTI (Neuroimaging Informatics Technology Initiative) data format (n = 15). All pipelines can process standard 3D single postlabeling delay pseudo-continuous ASL images and primarily differ in their support of advanced sequences and features. The publicly available pipelines (n = 9) were included in the independent testing, all of them being free for noncommercial use. The pipelines, in general, provided a trade-off between ease of use and flexibility for configuring advanced processing options. CONCLUSION: Although most ASL pipelines can process the common ASL data types, only some (namely, ASLPrep, ASLtbx, BASIL/Quantiphyse, ExploreASL, and MRICloud) are well-documented, publicly available, support multiple ASL types, have a user-friendly interface, and can provide a useful starting point for ASL processing. The choice of an optimal pipeline should be driven by specific data to be processed and user experience, and can be guided by the information provided in this ASL inventory.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,020 | 0,042 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,155 | 0,126 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».