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Enregistrement W4387454215 · doi:10.1101/2023.10.04.560756

<i>Capitella teleta</i> gets left out: Possible evolutionary shift causes loss of left tissues rather than increased neural tissue from dominant-negative BMPR1

2023· preprint· en· W4387454215 sur OpenAlexaff
Nicole B. Webster, Néva P. Meyer

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNational Science Foundation
Mots-clésChordinNeuroectodermBiologyEctodermBrachyuryPhenotypeEctopic expressionGastrulationMesodermEndodermBilateriaNeural plateGeneticsAnatomyNeuroscienceNeural tubeEmbryogenesisEmbryoGeneEmbryonic stem cellPhylogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background The evolution of centralized nervous systems (CNSs) a fascinating and complex topic; further work is needed to understand the genetic and developmental homology between organisms with a CNS. Research into a limited number of species suggests that CNSs may be homologous across Bilateria. This hypothesis is based in part on similar functions of BMP signaling in establishing fates along the dorsal-ventral (D-V) axis including limiting neural specification to one region of ectoderm. From an evolutionary-developmental perspective, the best way to understand a system is to explore it in a wide range of organisms to create a full picture. Methods Here we expand our understanding of BMP signaling in Spiralia, the third major clade of bilaterians, by examining phenotypes after expression of a dominant-negative BMP Receptor 1 and after knock-out of the putative BMP antagonist Chordin-like using CRISPR/Cas9 gene editing in the annelid Capitella teleta (Pleistoannelida). Results Ectopic expression of the dominant-negative Cte-BMPR1 did not increase CNS tissue or alter overall D-V axis formation in the trunk. Instead, we observed a unique asymmetric phenotype: a distinct loss of left tissues including the left eye, brain, foregut, and trunk mesoderm. Adding ectopic BMP4 early during cleavage stages reversed the dominant-negative Cte-BMPR1 phenotype, leading to a similar loss or reduction of right tissues instead. Surprisingly, a similar asymmetric loss of left tissues was evident from CRISPR knock-out of Cte-Chordin-like but concentrated in the trunk rather than the episphere. Conclusions We further solidify the hypothesis that the function of BMP signaling during establishment of the D-V axis and CNS is fundamentally different in at least Pleistoannelida, possibly in Spiralia, and is not required for nervous system delimitation in this group. Our results support hypotheses of either multiple evolutionary origins of CNSs across Bilateria or divergence in the molecular mechanisms of CNS specification and D-V axis formation in annelids.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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