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Enregistrement W4387568406 · doi:10.1101/2023.10.11.23296862

Two neurostructural subtypes: results of machine learning on brain images from 4,291 individuals with schizophrenia

2023· preprint· en· W4387568406 sur OpenAlexafffund
Yuchao Jiang, Cheng Luo, Jijun Wang, Lena Palaniyappan, Xiao Chang, Shitong Xiang, Jie Zhang, Mingjun Duan, Huan Huang, Christian Gaser, Kiyotaka Nemoto, Kenichiro Miura, Ryota Hashimoto, Lars T. Westlye, Geneviève Richard, Sara Fernández‐Cabello, Nadine Parker, Ole A. Andreassen, Tilo Kircher, Igor Nenadić, Frederike Stein, Florian Thomas‐Odenthal, Lea Teutenberg, Paula Usemann, Udo Dannlowski, Tim Hahn, Dominik Grotegerd, Susanne Meinert, Rebekka Lencer, Yingying Tang, Tianhong Zhang, Chunbo Li, Weihua Yue, Yuyanan Zhang, Xin Yu, Enpeng Zhou, Ching‐Po Lin, Shih‐Jen Tsai, Amanda Rodrigue, David C. Glahn, Godfrey D. Pearlson, John Blangero, Andriana Karuk, Edith Pomarol‐Clotet, Raymond Salvador, Paola Fuentes‐Claramonte, María Ángeles García‐León, Gianfranco Spalletta, Fabrizio Piras, Daniela Vecchio, Nerisa Banaj, Jingliang Cheng, Zhening Liu, Jie Yang, Ali Saffet Gönül, Özgül Uslu, Birce Begüm Burhanoğlu, Aslihan Uyar-Demir, Kelly Rootes-Murdy, Vince D. Calhoun, Kang Sim, Melissa J. Green, Yann Quidé, Young‐Chul Chung, Woo‐Sung Kim, Scott R. Sponheim, Caroline Demro, Ian S. Ramsay, Felice Iasevoli, Andrea de Bartolomeis, Annarita Barone, Mariateresa Ciccarelli, Arturo Brunetti, Sirio Cocozza, Giuseppe Pontillo, Mario Tranfa, Min Tae M Park, Matthias Kirschner, Foivos Georgiadis, Stefan Kaiser, Tamsyn E. Van Rheenen, Susan L. Rossell, Matthew Hughes, Will Woods, Sean Carruthers, Philip Sumner, Elysha Ringin, Filip Španiel, Antonín Škoch, David Tomeček, Philipp Homan, Stephanie Homan, Wolfgang Omlor, Giacomo Cecere, Dana D. Nguyen, Adrian Preda, Sophia I. Thomopoulos, Neda Jahanshad, Long‐Biao Cui, Dezhong Yao, Paul M. Thompson, Jessica A. Turner, Theo G.M. van Erp, Wei Cheng, Jianfeng Feng

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental HealthMcGill UniversityDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthHelse Sør-Øst RHFJapan Society for the Promotion of ScienceFonds de Recherche du Québec - SantéNovartis FoundationHORIZON EUROPE Framework ProgrammeNational Institutes of HealthCanada First Research Excellence FundNational Healthcare GroupNorges ForskningsrådScience and Technology Commission of Shanghai MunicipalityMinistero della SaluteChina Postdoctoral Science FoundationU.S. Department of EnergyNational Natural Science Foundation of ChinaMcGill UniversityJapan Agency for Medical Research and DevelopmentDeutsche ForschungsgemeinschaftEuropean CommissionNational Alliance for Research on Schizophrenia and DepressionKorea Health Industry Development InstituteUniversity of MinnesotaMassachusetts General HospitalUniversità degli Studi di Napoli Federico IIU.S. Department of Veterans AffairsShanghai Rising-Star Program
Mots-clésSchizophrenia (object-oriented programming)NeuroimagingAmygdalaStriatumAnxietyTemporal lobePsychologyHippocampusMagnetic resonance imagingThalamusNeuroscienceDepression (economics)Temporal cortexMedicinePsychiatryDopamineEpilepsy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Machine learning can be used to define subtypes of psychiatric conditions based on shared clinical and biological foundations, presenting a crucial step toward establishing biologically based subtypes of mental disorders. With the goal of identifying subtypes of disease progression in schizophrenia, here we analyzed cross-sectional brain structural magnetic resonance imaging (MRI) data from 4,291 individuals with schizophrenia (1,709 females, age=32.5 years±11.9) and 7,078 healthy controls (3,461 females, age=33.0 years±12.7) pooled across 41 international cohorts from the ENIGMA Schizophrenia Working Group, non-ENIGMA cohorts and public datasets. Using a machine learning approach known as Subtype and Stage Inference (SuStaIn), we implemented a brain imaging-driven classification that identifies two distinct neurostructural subgroups by mapping the spatial and temporal trajectory of gray matter (GM) loss in schizophrenia. Subgroup 1 (n=2,622) was characterized by an early cortical-predominant loss (ECL) with enlarged striatum, whereas subgroup 2 (n=1,600) displayed an early subcortical-predominant loss (ESL) in the hippocampus, amygdala, thalamus, brain stem and striatum. These reconstructed trajectories suggest that the GM volume reduction originates in the Broca's area/adjacent fronto-insular cortex for ECL and in the hippocampus/adjacent medial temporal structures for ESL. With longer disease duration, the ECL subtype exhibited a gradual worsening of negative symptoms and depression/anxiety, and less of a decline in positive symptoms. We confirmed the reproducibility of these imaging-based subtypes across various sample sites, independent of macroeconomic and ethnic factors that differed across these geographic locations, which include Europe, North America and East Asia. These findings underscore the presence of distinct pathobiological foundations underlying schizophrenia. This new imaging-based taxonomy holds the potential to identify a more homogeneous sub-population of individuals with shared neurobiological attributes, thereby suggesting the viability of redefining existing disorder constructs based on biological factors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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