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Enregistrement W4387572133 · doi:10.1111/trf.289_17554

P‐PB‐1 | Probability of Finding Partially or Fully Compatible Blood for Patients with Sickle Cell Disease: A Descriptive Analysis of Donor‐Recipient Genotype Data

2023· article· en· W4387572133 sur OpenAlexaff
William Lemieux, Gabriel André Leiva‐Torres, C. Maude, Jessica Constanzo‐Yanez, Yves Pastore, Nancy Robitaille, Antoine Lewin

Notice bibliographique

RevueTransfusion · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHemoglobinopathies and Related Disorders
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineHéma-Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineHumanitiesPsychologyPhilosophy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alloimmunization substantially increases the risk of future hemolytic transfusion reactions. Alloimmunization can be prevented by transfusing fully matched RBC units, which is made easier by advances in RBC genotyping. This study aimed to estimate the probability of finding a perfect match between the blood of a patient with sickle cell disease (SCD) and the blood of regular donors or donors with rare blood. Moreover, the impact of a simulate intensive recruitment campaign of new donors (+1000) from the general population was performed. Blood donors and patients with SCD were first identified in separate databases. Specifically, the genotype and phenotype data of active donors (N = 194,853—91.0% White, 1.2% Black and 7.8% other; i.e., who donated at least once from January 1, 2019 to December 21, 2021) and rare blood donors (N = 708) were obtained (database compiled and updated by the provincial reference laboratory). Since December 2020, all donors are phenotyped for C, E, c, e, and K antigens (Ag). Data from a cohort of SCD patients previously genotyped (N = 270) were also obtained. The probability of a perfect donor-recipient match was then based on the recorded phenotype (deduced from genotype data) for the ABO, Rh (D, C, E or C/c, E/e), K, Fya, Fyb, V, VS, and hrB Ags. When considering only ABO, D, C, E, and K Ags, the probability of a perfect match was 100.0% with the active and rare donor databases (combined). However, when additionally considering c and e, this probability dropped to 69.3% with the active donor database (alone) and to 78.1% with the active and rare donor databases (combined; Table 1). Finally, when considering all Ags (i.e., adding Fya, Fyb, V, VS, hrB), the probability of a perfect match was only 0.5% with the active donor database (alone) and 23.9% with the active and rare donor databases (combined). Adding 1000 simulated fully typed donors (based on Ag frequencies observed in the active donors) was estimated to increase this probability to a mean of 42.5% (standard deviation = 15.8%). TABLE 1. Observed and simulated match probabilities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,020
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,020
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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