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Enregistrement W4387579606 · doi:10.3389/fpls.2023.1272362

Postglacial phylogeography, admixture, and evolution of red spruce (Picea rubens Sarg.) in Eastern North America

2023· article· en· W4387579606 sur OpenAlexafffund
Stanislav Bashalkhanov, Jeremy S. Johnson, Om P. Rajora

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesCanadian Forest ServiceNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Park ServiceU.S. Forest ServiceNew York State Department of Environmental ConservationU.S. Department of Agriculture
Mots-clésBlack spruceEcologyAllopatric speciationPopulationPhylogeographyRange (aeronautics)BiologyGenetic structureGenetic diversitySympatric speciationLast Glacial MaximumGlacial periodTaigaPaleontologyPhylogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Climate change is a major evolutionary force that can affect the structure of forest ecosystems worldwide. Red spruce (Picea rubensSarg.) has recently faced a considerable decline in the Southern Appalachians due to rapid environmental change, which includes historical land use, and atmospheric pollution. In the northern part of its range, red spruce is sympatric with closely related black spruce (Picea mariana(Mill.) B.S.P.), where introgressive hybridization commonly occurs. We investigated range-wide population genetic diversity and structure and inferred postglacial migration patterns and evolution of red spruce using nuclear microsatellites. Moderate genetic diversity and differentiation were observed in red spruce. Genetic distance, maximum likelihood and Bayesian analyses identified two distinct population clusters: southern glacial populations, and the evolutionarily younger northern populations. Approximate Bayesian computation suggests that patterns of admixture are the result of divergence of red spruce and black spruce from a common ancestor and then introgressive hybridization during post-glacial migration. Genetic diversity, effective population size (Ne) and genetic differentiation were higher in the northern than in the southern populations. Our results along with previously available fossil data suggest thatPicea rubensandPicea marianaoccupied separate southern refugia during the last glaciation. After initial expansion in the early Holocene, these two species faced a period of recession and formed a secondary coastal refugium, where introgressive hybridization occurred, and then both species migrated northward. As a result, various levels of black spruce alleles are present in the sympatric red spruce populations. Allopatric populations ofP. rubensandP. marianahave many species-specific alleles and much fewer alleles from common ancestry. The pure southern red spruce populations may become critically endangered under projected climate change conditions as their ecological niche may disappear.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,040

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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