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Enregistrement W4387615274 · doi:10.1161/res.133.suppl_1.p1163

Abstract P1163: Identifying Novel Intracellular Interactions Driving Membrane-bound Tumour Necrosis Factor-mediated Signalling In The Microvasculature

2023· article· en· W4387615274 sur OpenAlexaff
Yasaman Mostafaie, Julia Hanchard, Darcy Lidington, Steffen‐Sebastian Bolz

Notice bibliographique

RevueCirculation Research · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiotin and Related Studies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRHOACell biologyCytoskeletonSignal transductionActin cytoskeletonBiologyHedgehog signaling pathwayCellBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Elevated total peripheral resistance (TPR) is a hallmark of many cardiovascular diseases and furthers disease progression. We previously demonstrated that myogenic tone, regulated by membrane-bound tumour necrosis factor (mTNF) reverse signalling, is a primary modulator of TPR. Thus, inhibiting mTNF reverse signalling should reduce TPR with the potential to improve disease outcome. However, since mTNF is a ubiquitous protein with critical biological functions, its indiscriminate inhibition can cause widespread side effects. Therefore, therapeutics aiming to reduce myogenic tone and TPR must target other elements of mTNF reverse signalling. To identify these unknown participants of mTNF reverse signalling, we used proximity-dependent biotinylation coupled to mass spectrometry (BioID). Our search identified 42 high confidence hits that interact with and/or are proximal to mTNF’s cytoplasmic domain. Gene ontology (GO) analysis revealed that molecularly, these proteins are structural constituents of the cytoskeleton involved in actin and cell adhesion molecule binding. This aligns with our underlying hypothesis that mTNF functions as a mechanosensor that tethers to its receptors and initiates myogenic vasoconstriction in response to changes in transmural pressure. GO also identified proteins involved in MAPK and RhoA signalling, which are critically involved in myogenic vasoconstriction. Our most abundant hit (fold change = 12.6, p-value = 0.0023) is a cytoskeletal protein that plays a role in maintaining the structural integrity of cells. This protein also interacts with proteins involved in various signalling cascades, namely, RhoA and calcium-dependent signalling pathways. Thus, we hypothesize that this protein is essential for formation of signalling complexes with mTNF and interacts with other proteins to mediate reverse signalling . We will employ a bioluminescence-based approach to quantify the strength of all interactions detected by BioID and identify small molecule inhibitors that can disrupt these interactions. These newly discovered inhibitors could potentially be used as novel therapeutics targeting myogenic tone and hence, elevated TPR to improve disease management and clinical outcome of cardiovascular diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,787
Score d'incertitude au seuil0,500

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,082
Tête enseignante GPT0,359
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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Résumé présentoui

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