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Enregistrement W4387620940 · doi:10.1161/res.133.suppl_1.p1098

Abstract P1098: Molecular Maturation Of Engrafted Human Pluripotent Stem Cell-derived Cardiomyocytes

2023· article· en· W4387620940 sur OpenAlexaff
Juliana Gomez, Wenlei Jiang, Beiping Qiang, Gary D. Bader, Michael A. Laflamme

Notice bibliographique

RevueCirculation Research · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInduced pluripotent stem cellTransplantationBiologyCell biologyCell sortingPhenotypeStem cellEmbryonic stem cellDownregulation and upregulationNeuroscienceCellMedicineInternal medicineGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The transplantation of human pluripotent stem cell derived cardiomyocytes (hPSC-CMs) represents an attractive strategy to regenerate myocardium lost following injury and mitigate the pathological remodeling that ultimately leads to heart failure. However, in vitro hPSC-CMs have an immature phenotype that likely contributes to the transient arrhythmias observed during the initial weeks following hPSC-CM transplantation in large-animal models, hindering safe translation into the clinic. We hypothesized that maturational changes in hPSC-CMs in vivo facilitate the improved electrophysiological behavior of graft tissue observed at later time-points. Because the changing phenotype of hPSC-CM graft tissue remains largely unexplored, we used single nucleus RNA sequencing to evaluate the transcriptional dynamics and cell population heterogeneity of hPSC-CMs prior to transplantation and at 2- and 8-weeks following transplantation in a guinea pig cardiac cryoinjury model (n=3). We used methods based on the sorting of nuclei labeled by a genetically-encoded fluorescent reporter to enrich the proportion of human nuclei sequenced from the graft site and created a comprehensive atlas (> 20,000 cells) of host and graft cells present at the implantation site at both time-points. We identified an upregulation of genes involved in intracellular calcium handling, AMPK, and cAMP signaling pathways, as well as a metabolic shift in engrafted hPSC-CMs that we speculate supports their growth and enhanced electrophysiological function. Our study includes a comprehensive description of the temporal changes in hPSC-CM graft tissue at the single-cell resolution and provides unique insights into how these cells adapt to the injured heart environment and mature in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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