MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4387637010 · doi:10.1055/s-0043-1772606

SCL19A3 gene mutation with Leigh-like phenotype presentation: a potentially treatable disease

2023· article· en· W4387637010 sur OpenAlexaff
Leonardo Furtado Freitas, Eduardo Carvalho Miranda, Thelma Ribeiro Noce, Aline Pimentel Amaro, Márcio Luí­s Duarte

Notice bibliographique

RevueArquivos de Neuro-Psiquiatria · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health CentreMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHypoactivityExome sequencingNeuroimagingBasal gangliaPhenotypeMidbrainMutationCompound heterozygosityCerebellumNeurogeneticsMedicinePathologyGeneticsGeneNeuroscienceBiologyDiseaseCentral nervous system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A two-month-old boy presented with breastfeeding difficulty, hypoactivity, hyporeactivity, and seizures. Neuroimaging showed multiple areas of cytotoxic and vasogenic edema in the midbrain, cerebellum, basal ganglia, and brain hemispheres, with lactate peak ([ Figure 1 ]). Exome sequencing revealed a heterozygous mutation c.597dup (p.His200Serfs*25) in the SCL19A3 gene. Figure 1 Brain magnetic resonance imaging (MRI) scan at two months of age. Axial diffusion ( A , B ); fluid-attenuated inversion recovery (FLAIR) ( C ); apparent diffusion coefficient (ADC) map ( D , E ); and T2-weighted imaging ( F ). Symmetric areas of cytotoxic (red arrows) and vasogenic (asterisk) edema in the midbrain, superior vermis, subcortical white matter of the cerebral hemispheres, genu of the corpus callosum, internal capsules, and basal ganglia, mainly in the putamina and thalami. There are also some cystic changes in the occipital lobes (blue arrows). Magnetic resonance spectroscopy (MRS) ( G ) with intermediate TE (144 ms) showing the lactate inverted peaks at 1.3 ppm chemical shift (green arrow). The SCL19A3 gene encodes thiamine transporter-2. Mutations can result in thiamine metabolism dysfunction syndrome-2, and they can present as early as infantile Leigh-like syndrome,[ 1 ] a potentially treatable disease. This patient was submitted to thiamine and biotin replacement, but his evolution confirmed a poor prognosis ([ Figure 2 ]).[ 2 ] The poor outcome warrants genetic counseling for the families. Figure 2 Two-month follow-up after treatment with biotin and thiamine. Axial diffusion ( A ); FLAIR ( B ); T2- ( C ) and T1-weighted ( D ) multiplanar gradient-recalled (MPGR) imaging. Resolution of the areas with restriction diffusion and interval encephalomalacia and necrosis in the basal ganglia bilaterally, mainly in the thalami (arrows). There is diffuse cerebral atrophy and holohemispheric subdural hematomas (asterisk), due to stretching of the bridging veins. Authors' Contributions LFF: conceptualization, formal analysis, investigation, validation, visualization, writing of the original draft, and writing – review and editing; ECM: formal analysis, investigation, visualization, and writing – review & editing; TRN: formal analysis, funding acquisition, supervision, validation, and visualization; APA: investigation, supervision, validation, visualization, and writing of the original draft; MLD: validation, visualization, writing of the original draft, and writing – review and editing. Publication History Received: 26 May 2023 Accepted: 24 June 2023 Article published online: 13 October 2023 © 2023. The Author(s). This is an open access article published by Thieme under the terms of the Creative Commons Attribution 4.0 International License, permitting copying and reproduction so long as the original work is given appropriate credit (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/) Thieme Revinter Publicações Ltda. Rua do Matoso 170, Rio de Janeiro, RJ, CEP 20270-135, Brazil

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueArquivos de Neuro-PsiquiatriaMême sujetIon Transport and Channel RegulationTravaux en français237 207