Combined Connectomics, <scp><i>MAPT</i></scp> Gene Expression, and Amyloid Deposition to Explain Regional Tau Deposition in Alzheimer Disease
Notice bibliographique
Résumé
Objective We aimed to test whether region‐specific factors, including spatial expression patterns of the tau‐encoding gene MAPT and regional levels of amyloid positron emission tomography (PET), enhance connectivity‐based modeling of the spatial variability in tau‐PET deposition in the Alzheimer disease (AD) spectrum. Methods We included 685 participants (395 amyloid‐positive participants within AD spectrum and 290 amyloid‐negative controls) with tau‐PET and amyloid‐PET from 3 studies (Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative, 18 F‐AV‐1451‐A05, and BioFINDER‐1). Resting‐state functional magnetic resonance imaging was obtained in healthy controls (n = 1,000) from the Human Connectome Project, and MAPT gene expression from the Allen Human Brain Atlas. Based on a brain‐parcellation atlas superimposed onto all modalities, we obtained region of interest (ROI)‐to‐ROI functional connectivity, ROI‐level PET values, and MAPT gene expression. In stepwise regression analyses, we tested connectivity, MAPT gene expression, and amyloid‐PET as predictors of group‐averaged and individual tau‐PET ROI values in amyloid‐positive participants. Results Connectivity alone explained 21.8 to 39.2% (range across 3 studies) of the variance in tau‐PET ROI values averaged across amyloid‐positive participants. Stepwise addition of MAPT gene expression and amyloid‐PET increased the proportion of explained variance to 30.2 to 46.0% and 45.0 to 49.9%, respectively. Similarly, for the prediction of patient‐level tau‐PET ROI values, combining all 3 predictors significantly improved the variability explained (mean adjusted R 2 range across studies = 0.118–0.148, 0.156–0.196, and 0.251–0.333 for connectivity alone, connectivity plus MAPT expression, and all 3 modalities combined, respectively). Interpretation Across 3 study samples, combining the functional connectome and molecular properties substantially enhanced the explanatory power compared to single modalities, providing a valuable tool to explain regional susceptibility to tau deposition in AD. ANN NEUROL 2024;95:274–287
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».