A single <i>Microcoleus</i> species causes benthic cyanotoxic blooms worldwide
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Recently, proliferations of benthic cyanobacteria producing derivatives of anatoxin-a have been reported in rivers all over the world. In three river systems, in New Zealand, the USA, and Canada, a cohesive cluster of Microcoleus strains was responsible for toxin production. Here, we document a similar toxigenic event that occurred at the mouth of the river Areuse in lake Neuchâtel (Switzerland) and caused the death of several dogs. Using 16S RNA-based community analysis, we show that riverine benthic communities are dominated by Oscillatoriales and especially by Microcoleus strains. We correlate the detection of one sequence variant with the presence of anatoxin-a derivatives and use metagenomics to assemble a complete circular genome of the strain. The strain is distinct from the ones isolated in New Zealand, the USA, and Canada, but belongs to the same species; it shares significant traits with them, in particular a relatively small genome and incomplete vitamin biosynthetic pathways. Overall, our results suggest that the major anatoxin-a-associated benthic proliferations worldwide can be traced back to a single ubiquitous species, Microcoleus anatoxicus, rather than to a diversity of cyanobacterial lineages. We recommend that this species be monitored internationally in order to help predict and mitigate similar cyanotoxic events.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».