High‐resolution and quantitative spatial analysis reveal intra‐ductal phenotypic and functional diversification in pancreatic cancer
Notice bibliographique
Résumé
Abstract A ‘classical’ and a ‘basal‐like’ subtype of pancreatic cancer have been reported, with differential expression of GATA6 and different dosages of mutant KRAS . We established in situ detection of KRAS point mutations and mRNA panels for the consensus subtypes aiming to project these findings to paraffin‐embedded clinical tumour samples for spatial quantitative analysis. We unveiled that, next to inter‐patient and intra‐patient inter‐ductal heterogeneity, intraductal spatial phenotypes exist with anti‐correlating expression levels of GATA6 and KRAS G12D . The basal‐like mRNA panel better captured the basal‐like cell states than widely used protein markers. The panels corroborated the co‐existence of the classical and basal‐like cell states in a single tumour duct with functional diversification, i.e. proliferation and epithelial‐to‐mesenchymal transition respectively. Mutant KRAS G12D detection ascertained an epithelial origin of vimentin‐positive cells in the tumour. Uneven spatial distribution of cancer‐associated fibroblasts could recreate similar intra‐organoid diversification. This extensive heterogeneity with functional cooperation of plastic tumour cells poses extra challenges to therapeutic approaches. © 2023 The Authors. The Journal of Pathology published by John Wiley & Sons Ltd on behalf of The Pathological Society of Great Britain and Ireland.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».