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Enregistrement W4387664548 · doi:10.1139/as-2023-0028

Pilot study: decoding the skin microbiome of bowhead (<i>Balaena mysticetus</i>) and killer whales (<i>Orcinus orca</i>) in Nunavut, Canada

2023· article· en· W4387664548 sur OpenAlexafffundvenueabout
Carlos Domínguez-Sánchez, Steven H. Ferguson, Tera Edkins, Brent G. Young, Joshua Kringorn

Notice bibliographique

RevueArctic Science · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMarine animal studies overview
Établissements canadiensFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesFisheries and Oceans Canada
Mots-clésBiologyMicrobiomeBeluga WhaleZoologyWhaleVibrioMicrobiologyArcticEcologyBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Given the increasing challenges that Arctic cetaceans face, it is critical to investigate novel methods for assessing their health. Skin microbiomes have emerged as a promising method of detecting health issues that can help guide conservation efforts for free-ranging cetaceans. This study characterized the skin microbiome of 17 bowhead (BW) and 2 killer whales (KW). Fifty-six amplicon sequence variants were identified exclusively from cetacean samples, 20 belonged to BW, 13 to KW, and 23 to BW and KW. We identified bacteria from the genera Tenacibaculum and Psychrobacter, which have been previously described as bacteria that play a role in the health of cetaceans. In addition, in the healthy bowhead whale (H-BW) samples, we identified Clostridium sensu stricto 1 and 7, Carnobacterium spp., and Yersinia spp. which are of concern because these bacteria are opportunistic pathogens. Stranded BW had a less diverse microbiome than H-BW and had pathogens, including Aeromonas species and Streptococcus agalactia. Opportunistic pathogens of the genera Moritella (previously Vibrio spp.), Shewanella, Psychrilyobacter, and Legionella were discovered in KW. Due to their predator–prey relationships, the findings of this pilot study support the importance of keeping a close eye on the bowhead and killer whale populations in the Arctic.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,136
Score d'incertitude au seuil0,481

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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