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Enregistrement W4387675036 · doi:10.1002/jex2.115

Cell culture‐derived extracellular vesicles: Considerations for reporting cell culturing parameters

2023· article· en· W4387675036 sur OpenAlexaff
Faezeh Shekari, Faisal J. Alibhai, Hossein Baharvand, Verena Börger, Stefania Bruno, Owen G. Davies, Bernd Giebel, Mario Gimona, Ghasem Hosseini Salekdeh, Lorena Martín‐Jaular, Suresh Mathivanan, Inge Nelissen, Esther N. M. Nolte‐‘t Hoen, Lorraine O’Driscoll, Francesca Perut, Stefano Pluchino, Gabriella Pòcsfalvi, Carlos Salomón, Carolina Soekmadji, Simon Staubach, Ana Cláudia Torrecilhas, Ganesh Vilas Shelke, Tobias Tertel, Dandan Zhu, Clotilde Théry, Kenneth W. Witwer, Rienk Nieuwland

Notice bibliographique

RevueJournal of Extracellular Biology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Cancer InstituteNational Institute on Drug AbuseNational Institute of Mental Health
Mots-clésExtracellular vesiclesExtracellular vesicleStandardizationExtracellularVesicleFunction (biology)CellCell biologyChecklistBiotechnologyBiologyBiochemical engineeringComputer scienceBiochemistryMicrovesiclesEngineeringMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cell culture-conditioned medium (CCM) is a valuable source of extracellular vesicles (EVs) for basic scientific, therapeutic and diagnostic applications. Cell culturing parameters affect the biochemical composition, release and possibly the function of CCM-derived EVs (CCM-EV). The CCM-EV task force of the Rigor and Standardization Subcommittee of the International Society for Extracellular Vesicles aims to identify relevant cell culturing parameters, describe their effects based on current knowledge, recommend reporting parameters and identify outstanding questions. While some recommendations are valid for all cell types, cell-specific recommendations may need to be established for non-mammalian sources, such as bacteria, yeast and plant cells. Current progress towards these goals is summarized in this perspective paper, along with a checklist to facilitate transparent reporting of cell culturing parameters to improve the reproducibility of CCM-EV research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,168
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,215
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,832
Score d'incertitude au seuil0,889

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1680,215
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0060,005
Études des sciences et des technologies0,0040,004
Communication savante0,0080,005
Science ouverte0,0060,006
Intégrité de la recherche0,0060,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomainePrésentation des résultats
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations73
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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