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Enregistrement W4387675350 · doi:10.1530/rep-23-0230

DCAF13 and RNF114 participate in the regulation of early porcine embryo development

2023· article· en· W4387675350 sur OpenAlexaff
Zigomar da Silva, Werner Giehl Glanzner, Karina Gutierrez, Mariana Priotto de Macedo, Vanessa Guay, Luke Currin, Maria Elena Herrera Carrillo, Paulo Bayard Dias Gonçalves, Vilceu Bordignon

Notice bibliographique

RevueReproduction · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensMcGill UniversitySte. Anne's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBlastocystEmbryoCell biologyHistoneBiologyUbiquitinUbiquitin ligaseEmbryogenesisDNA damageMolecular biologyGeneticsDNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In brief: Ubiquitination plays a pivotal role in a multitude of cellular functions; however, the precise contributions of various ubiquitin ligases in governing early developmental processes remain largely unexplored. This study revealed that the E3 ubiquitin ligases DCAF13 and RNF114 are both necessary for the normal regulation of early porcine embryo development. Abstract: Ubiquitylation is required for normal regulation of many biological functions by modulating several protein facets such as structure, stability, interaction, localization, and degradation. In this study, we explored the roles of two E3 ubiquitin ligases (E3s), the DDB1- and CUL4-associated factor 13 (DCAF13) and the Ring finger protein 114 (RNF114), in the regulation of porcine embryo development. Attenuation of DCAF13 mRNA decreased embryo development at the blastocyst stage, while the development of RNF114-attenuated embryos was not significantly different than that of control embryos. The average number of cells per blastocyst was decreased in DCAF13-attenuated embryos and increased in RNF114-attenuated embryos compared to controls. The relative mRNA abundance of the histone methyltransferase SUV39H1, which regulates histone H3 lysine 9 trimethylation (H3K9me3), was increased in both DCAF13- and RNF114-attenuated embryos, but nuclear immunofluorescence signal for H3K9me3 on day 3 embryos was not significantly altered between attenuated and control embryos. Nuclear immunofluorescence signal for H3K4m3 was decreased in DCAF13-attenuated embryos, but it was increased in RNF114-attenuated embryos compared to controls. Attenuation of DCAF13 and RNF114 mRNAs increased transcript levels for the DNA recombinase RAD51 and decreased expression of phosphorylated histone H2A.X (γH2AX), which suggests an impact on DNA damage repair. In addition, lower mRNA expression of the lysine demethylases 5B (KDM5B) and 5C (KDM5C), both involved in embryo genome activation and DNA repair, was detected in DCAF13-attenuated embryos. These findings indicated that both DCAF13 and RNF114 have important roles in the regulation of the early development of porcine embryos.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,383
Score d'incertitude au seuil0,145

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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