Prominence of Candidate Phyla Radiation (CPR) in Alberta Groundwater
Notice bibliographique
Résumé
Groundwater is an essential part of everyday life, serving as agricultural irrigation, supporting numerous industrial processes, and providing drinking water for many. It is also home to a diverse range of unexplored microbial communities. This is especially true in Alberta, Canada, due to the rich geological history of the region and the close proximity of aquifer locations to areas ranging from oil sand-rich to agricultural to populous cities. Through collaborations with the Environment and Protected Areas division of the Alberta government we have access to more than 250 wells throughout the province, 25 of which were selected for metagenomics analysis. More than 750 metagenome-assembled genomes were recovered and coupled with historic geochemical, isotopic, and dissolved gas data, allowing us to interpret the lifestyles of microbial communities inhabiting Alberta groundwater. Results show a strong presence of organisms involved in C1-cycling, indicative of a productive subsurface environment, as well as members belonging to the Candidate Phyla Radiation (CPR). We explore likely roles of CPR, including their potential for ecological interactions via secondary metabolites. This research shows that Alberta groundwater is home to diverse, productive microbial communities that have the capacity to further our knowledge in microbial ecology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».