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Enregistrement W4387728732 · doi:10.1007/s13659-023-00408-w

Cytotoxic phenazine and antiallergic phenoxazine alkaloids from an arctic Nocardiopsis dassonvillei SCSIO 502F

2023· article· en· W4387728732 sur OpenAlexaff
Yue Song, Q. Li, Mengjing Cong, Xiaoyan Pang, Bo Chen, Yonghong Liu, Li Liao, Junfeng Wang

Notice bibliographique

RevueNatural Products and Bioprospecting · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesBasic and Applied Basic Research Foundation of Guangdong ProvinceNational Key Research and Development Program of ChinaSouth China Sea Institute of Oceanology, Chinese Academy of SciencesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésPhenazinePhenoxazineIC50Bioorganic chemistryChemistryMicrobiologyBiologyIn vitroBiochemistryPharmacology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Microbes well-adapted to the Arctic Ocean are promising for producing novel compounds, due to their fancy strategies for adaptation and being under-investigated. Two new phenazine alkaloids ( 1 and 2 ) and one new phenoxazine ( 3 ) were isolated from Nocardiopsis dassonvillei 502F, a strain originally isolated from Arctic deep-sea sediments. AntiSMASH analysis of the genome of Nocardiopsis dassonvillei 502F revealed the presence of 16 putative biosynthetic gene clusters (BGCs), including a phenazine BGC. Most of the isolated compounds were evaluated for their antibacterial, antiallergic, and cytotoxic activities. Among them, compounds 4 and 5 exhibited potent in vitro cytotoxic activities against osteosarcoma cell line 143B with IC 50 values 0.16 and 20.0 μM, respectively. Besides, the results of antiallergic activities of compounds 6 – 8 exhibited inhibitory activities with IC 50 values of 10.88 ± 3.05, 38.88 ± 3.29, and 2.44 ± 0.17 μg/mL, respectively (IC 50 91.6 μM for the positive control loratadine). Graphical Abstract

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,374
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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