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Enregistrement W4387732600 · doi:10.14309/01.ajg.0000957044.85390.98

S1851 Physiology-Guided, Mechanism-Based Digital Phenotyping of Gastroduodenal Symptoms

2023· article· en· W4387732600 sur OpenAlexaff
Chris Varghese, Gabriel Schamberg, Stefan Calder, Mikaela Law, Daphne Foong, Vincent Ho, Peng Du, Charlotte Daker, Christopher N. Andrews, Armen A. Gharibans, Greg O’Grady

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Gastroenterology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTraditional Chinese Medicine Studies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineMealInternal medicineNauseaVomitingGastroenterologyAnxietyStomachProspective cohort studyPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Current classification schemes for chronic gastroduodenal symptoms substantially overlap and therefore do not clearly guide patient-specific therapy. We hypothesised that a mechanism-based approach to symptom classification may offer a valid and more specific alternative scheme. Methods: We performed a multicenter, prospective cohort study of patients meeting Rome-IV criteria for functional dyspepsia (FD) and chronic nausea and vomiting syndromes (CNVS). Gastric Alimetry™ (Alimetry, New Zealand) was used for body surface gastric mapping spectral analysis and time-of-test symptom profiling. A standardized digital classification framework separated patients into those with a) abnormal spectral analyses (suspected neuromuscular pathologies); normal spectral analyses with b) symptoms correlated to gastric amplitude (sensorimotor, post-gastric, and activity-relieved); and c) symptoms independent of gastric amplitude (continuous, meal-relieved, meal-induced). Results: 210 patients (80% female, median age 37) of whom 169 met criteria for CNVS and 206 met criteria for FD (79% overlapping) were included. Overall, 83% with unexplained gastroduodenal symptoms were phenotyped, with 79/210 (37.6%) classified as having a spectral abnormality on gastric mapping. Of the remaining 131, 37 (17.6%) were classified as ‘continuous pattern’, 28 (13.3%) as ‘meal-induced pattern’, and 15 (7.1%) as ‘sensorimotor pattern’. When spectral analyses were normal, symptom patterns that were independent of gastric amplitude such as continuous, meal-relieved, and meal-induced patterns were more strongly correlated with depression and anxiety (PHQ-2: exp(β) 2.38, P = 0.024), STAI-SF score: exp(β) 1.21, P = 0.021). Conclusion: Standardized time-of-test symptom profiles offer a novel approach to classifying patients based on proposed mechanisms of disease. These groupings correlated with chronic symptoms, quality of life, and psychological factors, demonstrating initial clinical validity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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