Degenerative Cervical Myelopathy induces sex-specific dysbiosis in mice
Notice bibliographique
Résumé
Degenerative Cervical Myelopathy (DCM) is the most common cause of spinal cord impairment in elderly populations. It describes a spectrum of disorders that cause progressive spinal cord compression, neurological impairment, loss of bladder and bowel functions, and gastrointestinal dysfunction. The gut microbiota has been recognized as an environmental factor that can modulate both the function of the central nervous system and the immune response through the microbiota-gut-brain axis. Changes in gut microbiota composition or microbiota-producing factors have been linked to the progression and development of several pathologies. However, little is known about the potential role of the gut microbiota in the pathobiology of DCM. Here, DCM was induced in C57BL/6 mice by implanting an aromatic polyether material underneath the C5-6 laminae. The extent of DCM-induced changes in microbiota composition was assessed by 16S rRNA sequencing of the fecal samples. The immune cell composition was assessed using flow cytometry. To date, several bacterial members have been identified using BLAST against the largest collection of metagenome-derived genomes from the mouse gut. In both, female and males DCM caused gut dysbiosis compared to the sham group. However, dysbiosis was more pronounced in males than in females, and several bacterial members of the families Lachnospiraceae and Muribaculaceae were significantly altered in the DCM group. These changes were also associated with altered microbe-derived metabolic changes in propionate-, butyrate-, and lactate-producing bacterial members. Our results demonstrate that DCM causes dynamic changes over time in the gut microbiota, reducing the abundance of butyrate-producing bacteria, and lactate-producing bacteria to a lesser extent. Genome-scale metabolic modeling using gapseq successfully identified pyruvate-to-butanoate and pyruvate-to-propionate reactions involving genes such as Buk and ACH1, respectively. These results provide a better understanding of the sex-specific molecular effects of changes in the gut microbiota on DCM pathobiology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».