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Enregistrement W4387814628 · doi:10.1007/s10344-023-01742-7

The DeepFaune initiative: a collaborative effort towards the automatic identification of European fauna in camera trap images

2023· article· en· W4387814628 sur OpenAlexfundno aff
Noa Rigoudy, Gaspard Dussert, Abdelbaki Benyoub, Aurélien Besnard, Carole Birck, Yoann Bollet, Yoann Bunz, Gérard Caussimont, Elias Chetouane, Jules Chiffard, Pierre Cornette, Anne Delestrade, Nina De Backer, Lucie Dispan, Maden Le Barh, Jeanne Duhayer, Jean-François Elder, Jean-Baptiste Fanjul, Jocelyn Fonderflick, Nicolas Froustey, Mathieu Garel, William Gaudry, Agathe Gérard, Olivier Giménez, Arzhela Hemery, Audrey Hemon, Jean‐Michel Jullien, Daniel Knitter, Isabelle Malafosse, Mircea Mărginean, Louise Ménard, Alice Ouvrier, Gwennaelle Pariset, Vincent Prunet, Julien Rabault, Malory Randon, Yann Raulet, Antoine Régnier, Romain Ribière, Jean-Claude Ricci, Sandrine Ruette, Yann Schneylin, Jérôme Sentilles, Nathalie Siefert, Bethany R. Smith, Guillaume Terpereau, Pierrick Touchet, Wilfried Thuiller, Antonio Uzal, Valentin Vautrain, Ruppert Vimal, Julian Weber, B. Spataro, Vincent Mièle, Simon Chamaillé‐Jammes

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Wildlife Research · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueSpecies Distribution and Climate Change
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesOffice Français de la BiodiversitéRégion NormandieRégion Auvergne-Rhône-AlpesCentre National de la Recherche ScientifiqueRégion Occitanie Pyrénées-MéditerranéeTrent UniversityNottingham Trent University
Mots-clésWildlifeCamera trapComputer scienceCitizen scienceMilestoneIdentification (biology)FaunaSoftwareArtificial intelligenceData scienceCartographyEcologyGeographyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Camera traps have revolutionized how ecologists monitor wildlife, but their full potential is realized only when the hundreds of thousands of collected images can be readily classified with minimal human intervention. Deep learning classification models have allowed extraordinary progress towards this end, but trained models remain rare and are only now emerging for European fauna. We report on the first milestone of the DeepFaune initiative ( https://www.deepfaune.cnrs.fr ), a large-scale collaboration between more than 50 partners involved in wildlife research, conservation and management in France. We developed a classification model trained to recognize 26 species or higher-level taxa that are common in Europe, with an emphasis on mammals. The classification model achieved 0.97 validation accuracy and often > 0.95 precision and recall for many classes. These performances were generally higher than 0.90 when tested on independent out-of-sample datasets for which we used image redundancy contained in sequences of images. We implemented our model in a software to classify images stored locally on a personal computer, so as to provide a free, user-friendly, and high-performance tool for wildlife practitioners to automatically classify camera trap images. The DeepFaune initiative is an ongoing project, with new partners joining regularly, which allows us to continuously add new species to the classification model.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,015
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,888
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0150,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,090
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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