Allopolyploidization from two dioecious ancestors leads to recurrent evolution of sex chromosomes and reversion to autosomes
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Polyploidization presents an unusual challenge for species with sex chromosomes, as it can lead to complex combinations of sex chromosomes that disrupt reproductive development. This is particularly true for allopolyploidization between species with different sex chromosome systems. Here we assemble haplotype-resolved chromosome-level genomes of a female allotetraploid weeping willow ( Salix babylonica ) and a male diploid Salix dunnii using Hi-C and PacBio HiFi reads. We use phylogenomics of nuclear and plastid genomes to show that weeping willow arose from crosses between female ancestor from the Salix clade, having XY sex chromosomes on chromosome 7, with a male ancestor from the Vetrix clade, having ancestral XY sex chromosomes on chromosome 15. Our analysis reveals that weeping willow has one pair sex chromosomes, ZW on chromosome 15, that derive from the ancestral XY sex chromosomes in the Vetrix- clade male ancestor, and the X chromosomes on chromosome 7 from the Salix- clade female ancestor has reverted to an autosome. Taken together, our results point to rapid evolution and reversion of sex chromosomes following allopolyploidization in weeping willow. Significance Statement We assembled haplotype-resolved genomes and obtained gap-free sex chromosomes of a female allotetraploid weeping willow ( Salix babylonica ) and a male diploid Salix dunnii . The weeping willow arose from two dioecious ancestors, that have XY sex chromosomes on chromosome 7 and 15, respectively. The one pair sex chromosomes 15W and 15Z in weeping willow derived from ancestral 15X and 15Y, respectively. Inversions contributed to the evolutions of sex-linked regions (SLRs) of diploid and polyploid willows.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».