MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4387820368 · doi:10.1101/2023.10.19.562135

Integrin-like adhesin CglD confers traction and stabilizes bacterial focal adhesions involved in myxobacterial gliding motility

2023· preprint· en· W4387820368 sur OpenAlexafffund
Nicolas Y. Jolivet, Endao Han, Akeisha M. Belgrave, Fares Saïdi, Newsha Koushki, David J. Lemon, Laura M. Faure, Betty Fleuchot, Utkarsha Mahanta, Heng Jiang, Gaurav Sharma, Jean-Bernard Fiche, Benjamin P. Bratton, Mamoudou Diallo, Beiyan Nan, David R. Zusman, Guillaume Sudre, Anthony G. Garza, Marcelo Nöllmann, Allen J. Ehrlicher, Olivier Théodoly, Joshua W. Shaevitz, Tâm Mignot, Salim T. Islam

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversité LavalConcordia UniversityPROTEOInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchCentre National de la Recherche ScientifiqueAix-Marseille UniversitéPrinceton UniversityFondation ARC pour la Recherche sur le CancerNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésCell biologyIntegrinBacterial adhesinGliding motilityMotilityFocal adhesionExtracellular matrixAdhesionBiologyCell adhesionBiophysicsCellSignal transductionChemistryBiochemistryEscherichia coliGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A bstract Integrins are crucial for eukaryotic cell attachment and motility within the extracellular matrix (ECM) via focal-adhesion formation, with their evolutionary emergence important for the development of multicellularity. Intriguingly, single gliding cells of the predatory deltaproteobacterium Myxococcus xanthus form bacterial focal-adhesion (bFA) sites; therein, helically-trafficked motors become immobilized at anchored locations through Glt apparatus association with cell-surface integrin αI-domain-like adhesin CglB. Using traction-force, bead-force, and total internal reflection-fluorescence microscopies combined with biochemical approaches, we herein identify the von Willebrand A domain-containing cell-surface lipoprotein CglD to be a β-integrin-like outer-membrane lipoprotein that functionally associates with and anchors the trans-envelope Glt–CglB gliding apparatus, stabilizing and efficiently anchoring this assembly at bFAs. Calcium dependence governs CglD importance, consistent with its integrated ECM eukaryotic cartilage oligomeric matrix protein domains. CglD thus confers mechanosensory and mechanotransductory capabilities to the gliding apparatus, helping explain bFA-mediated trans-envelope force transduction, from inner-membrane-embedded motors to the cell surface.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetCell Adhesion Molecules ResearchTravaux en français237 207