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Enregistrement W4387860920 · doi:10.1101/2023.10.21.563410

In Vitro Safety Signals for Potential Clinical Development of the Anti-Inflammatory Pregnane X Receptor Agonist FKK6

2023· preprint· en· W4387860920 sur OpenAlexaff
Zdeněk Dvořák, Barbora Vyhlídalová, Petra Pečinková, Hao Li, Pavel Anzenbacher, Alena Špičáková, Eva Anzenbacherová, Vimanda Chow, Jiabao Liu, Henry M. Krause, Derek J. Wilson, Tibor Béreš, Petr Tarkowski, Dajun Chen, Sridhar Mani

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHormonal Regulation and Hypertension
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesGrantová Agentura České Republiky
Mots-clésPregnane X receptorChemistryCYP3A4In vivoAgonistPharmacologyReceptorIn vitroMicrosomeBiochemistryNuclear receptorMetabolismCytochrome P450BiologyTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Background and purpose Based on the mimicry of microbial metabolites, functionalized indoles were demonstrated as the ligands and agonists of the pregnane X receptor (PXR). The lead indole, FKK6, displayed PXR-dependent protective effects in DSS-induced colitis in mice and in vitro cytokine-treated intestinal organoid cultures. Here, we performed the initial in vitro pharmacological profiling of FKK6. Experimental approach A complex series of cell-free and cell-based assays were employed. The organic synthesis, and advanced analytical chemistry methods were used. Key results FKK6-PXR interactions were characterized by hydrogen-deuterium exchange mass spectrometry. Screening FKK6 against potential cellular off-targets revealed high PXR selectivity. FKK6 has poor aqueous solubility but was highly soluble in simulated gastric and intestinal fluids. FKK6 was bound to plasma proteins and chemically stable in plasma. The partition coefficient of FKK6 was 2.70, and FKK6 moderately partitioned into red blood cells. In Caco2 cells, FKK6 displayed high permeability (A-B: 22.8 × 10 -6 cm.s -1 ) and no active efflux. These data are indicative of essentially complete in vivo absorption of FKK6. FKK6 was rapidly metabolized by cytochromes P450, notably by CYP3A4 in human liver microsomes. Two oxidized FKK6 derivatives, including N6-oxide and C19-phenol, were detected, and these metabolites had 5-7 × lower potency as PXR agonists than FKK6. This implies that despite high intestinal absorption, FKK6 is rapidly eliminated by the liver, and its PXR effects are predicted to be predominantly in the intestines. Conclusion and implications The PXR ligand and agonist FKK6 has a suitable pharmacological profile supporting its potential preclinical development. BULLET POINT SUMMARY What is already known: Microbial metabolite mimic FKK6 is a hPXR agonist with anti-inflammatory properties in mice and human. The in vitro PXR binding, absorption, and metabolism have not been completely characterized. What this study adds: PXR selectivity with unique binding mode, high intestinal cell permeability, rapid and complex microsomal metabolism. Initial testing for predicted metabolites shows reduced potency as PXR agonists. Clinical significance: PXR effects of FKK6 are predicted to be predominantly in the intestines. FKK6 has a suitable pharmacological profile supporting its potential preclinical development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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