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Enregistrement W4387865170 · doi:10.1002/cpz1.874

Synthesis of an <i>Ortho</i>‐Functionalized Tetrafluorinated Azobenzene Phosphoramidite for Incorporation into a Tetrafluorinated Azobenzene‐Containing siRNA for Photocontrolled Gene Silencing

2023· article· en· W4387865170 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueCurrent Protocols · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiquePhotochromic and Fluorescence Chemistry
Établissements canadiensOntario Tech University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAzobenzenePhosphoramiditeGene silencingChemistryCircular dichroismSmall interfering RNACombinatorial chemistryOligonucleotideMaterials scienceStereochemistryGeneRNAPolymerBiochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract This article presents the detailed synthesis and characterization protocols for an ortho‐ functionalized tetrafluorinated azobenzene containing siRNA, which has photoswitchable properties. To design this tetrafluorinated azobenzene scaffold, several synthetic steps are performed to generate a symmetrical tetrafluorinated azobenzene diol. This diol is treated with dimethoxytrityl chloride (DMT‐Cl) to protect one of the alcohols. Next, the DMT‐protected tetrafluorinated monoalcohol is phosphitylated to afford the DMT‐phosphoramidite building block used for solid‐phase synthesis. This paper also contains the detailed biophysical characterization, biological testing, and photo‐switching protocols of an ortho‐functionalized fluorinated azobenzene containing siRNA (F‐siRNA), which has photoswitchable properties that can be controlled with visible light. First, the F‐siRNA was characterized by annealing the sense and antisense strands together and then measuring the circular dichroism (CD) profile and melting temperature ( T m ) of the duplexes. Second, biological testing of the F‐siRNA is performed in cell culture to determine their gene silencing efficacy. Finally, their gene‐silencing activities are measured after exposure to green light to inactivate the F‐siRNA, followed by blue light, which reactivates the F‐siRNA. The F‐siRNA can be kept inactive for up to 72 hr and reactivated at any time within this 72‐hr window. © 2023 Wiley Periodicals LLC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,257
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle