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Enregistrement W4387878453 · doi:10.1186/s13071-023-05952-5

Prediction of Oncomelania hupensis distribution in association with climate change using machine learning models

2023· article· en· W4387878453 sur OpenAlexaff
Ning Xu, Yun Zhang, Chunhong Du, Jing Song, Junhui Huang, Yanfeng Gong, Honglin Jiang, Yixin Tong, Jiangfan Yin, Jiamin Wang, Feng Jiang, Yue Chen, Qingwu Jiang, Yi Dong, Yibiao Zhou

Notice bibliographique

RevueParasites & Vectors · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueParasites and Host Interactions
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOncomelania hupensisRandom forestSchistosoma japonicumSchistosomiasisOncomelaniaEcologyArtificial intelligenceMachine learningGeographyBiologyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Oncomelania hupensis is the sole intermediate host of Schistosoma japonicum. Its emergence and recurrence pose a constant challenge to the elimination of schistosomiasis in China. It is important to accurately predict the snail distribution for schistosomiasis prevention and control. METHODS: Data describing the distribution of O. hupensis in 2016 was obtained from the Yunnan Institute of Endemic Disease Control and Prevention. Eight machine learning algorithms, including eXtreme Gradient Boosting (XGB), support vector machine (SVM), random forest (RF), generalized boosting model (GBM), neural network (NN), classification and regression trees (CART), k-nearest neighbors (KNN), and generalized additive model (GAM), were employed to explore the impacts of climatic, geographical, and socioeconomic variables on the distribution of suitable areas for O. hupensis. Predictions of the distribution of suitable areas for O. hupensis were made for various periods (2030s, 2050s, and 2070s) under different climate scenarios (SSP126, SSP245, SSP370, and SSP585). RESULTS: The RF model exhibited the best performance (AUC: 0.991, sensitivity: 0.982, specificity: 0.995, kappa: 0.942) and the CART model performed the worst (AUC: 0.884, sensitivity: 0.922, specificity: 0.943, kappa: 0.829). Based on the RF model, the top six important variables were as follows: Bio15 (precipitation seasonality) (33.6%), average annual precipitation (25.2%), Bio2 (mean diurnal temperature range) (21.7%), Bio19 (precipitation of the coldest quarter) (14.5%), population density (13.5%), and night light index (11.1%). The results demonstrated that the overall suitable habitats for O. hupensis were predominantly distributed in the schistosomiasis-endemic areas located in northwestern Yunnan Province under the current climate situation and were predicted to expand north- and westward due to climate change. CONCLUSIONS: This study showed that the prediction of the current distribution of O. hupensis corresponded well with the actual records. Furthermore, our study provided compelling evidence that the geographical distribution of snails was projected to expand toward the north and west of Yunnan Province in the coming decades, indicating that the distribution of snails is driven by climate factors. Our findings will be of great significance for formulating effective strategies for snail control.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,046
Score d'incertitude au seuil0,441

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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