Genome of the glacier alga <i>Ancylonema</i> and its insights into the evolution of streptophyte life on ice and land
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Contemporary glaciers and ice sheets are home to communities of streptophyte glacier algae that must balance their requirements for photosynthesis and growth with tolerance of extremes in temperature, desiccation and UV radiation. These same environmental challenges have been hypothesized as the driving force behind the evolution of land plants from streptophyte algal ancestors in the Cryogenian (720–635 million years ago). Here, we sequence, assemble and analyze the metagenome-assembled genome (MAG) of the glacier alga Ancylonema nordenskiöldii to investigate its adaptations to life in ice, and whether this represents a vestige of Cryogenian anydrophyte exaptations. Phylogenetic analysis confirms the placement of glacier algae within the sister lineage to land plants, Zygnematophyceae. The MAG is characterized by an expansion of genes involved in high irradiance and UV light tolerance, whilst lineage-specific diversification led to the novel screening pigmentation of glacier algae. We found no support for the hypothesis of a common genomic basis for adaptations to ice and to land in streptophytes. Comparative genomic analysis revealed that reductive genome evolution in the ancestor of Zygnematophyceae correlates with their reductive morphological evolution. This first genome-scale data for glacier algae supports an Ancylonema -specific adaptation to the cryosphere, as well as shedding light on the genome evolution of land plants and Zygnematophyceae.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».