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Enregistrement W4387918383 · doi:10.1089/regen.2023.0012

Identification of p53-R175H Q167 and R248 as Residues Most Involved in Its Interaction with Plakoglobin

2023· article· en· W4387918383 sur OpenAlexaff
Chu Shiun Lo, Sara Ibrahim Omar, Jinlan Chang, Blessing Bassey‐Archibong, Jack A. Tuszyński, Nadia Jahroudi, Manijeh Pasdar

Notice bibliographique

RevueRe GEN Open · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPlakoglobinBiologyMutantCell biologyTransfectionWild typeGene knockdownMolecular biologyCell cultureGeneticsGeneSignal transductionCateninWnt signaling pathway

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The conformational p53-R175H is the most frequently occurring p53 mutant in cancers and a focus of mutant p53 targeted therapies. Plakoglobin is a dual cell adhesion and signaling protein with tumor suppressor activity. We previously showed that plakoglobin interacts with p53 and restores tumor suppressive activity of p53 mutants, including p53-R175H, in vitro. Method: Here, we used in silico modeling to predict the residues in p53-R175H that contribute the most to its interaction with plakoglobin, which identified p53-R175H Q167 and R248 as residues most involved in this interaction. To validate our in silico results, constructs were developed in which the predicted residues were substituted by alanine and transfected into the p53 null and plakoglobin deficient H1299 cells with or without plakoglobin. Transfectants expressing substituted residues were characterized using various biochemical and functional assays. Results: Co-immunoprecipitation and GST pull down assays showed a significant reduction in p53-R175H-plakoglobin association in p53-R175H-(Q167A, R248A and Q167A-R248A) transfectants. Despite the reduced interaction, in vitro invasion assays showed plakoglobin expression decreased invasiveness of all transfectants with the highest reduction in p53-R175H-R248A and R175H-Q167A-R248A expressing transfectants. Conclusion: These studies demonstrate, for the first time, the role of Q167 and R248 residues in p53-R175H's interaction with plakoglobin. The larger implication of these observations is the potential for exploring plakoglobin's interaction with p53-R175H mutant for the development of cancer therapeutics that restores the wild-type transcriptional activity/function of mutant p53s.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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