Investigating a role for <i>PUB17</i> and <i>PUB16</i> in the self-incompatibility pathway in transgenic <i>Arabidopsis thaliana</i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract In Brassicaceae self-incompatibility (SI), self-pollen rejection is initiated by the S- haplotype specific interactions between the pollen SCR/SP11 ligand and the stigma S Receptor kinase (SRK). In Brassica SI, a member of the Plant U-Box (PUB) E3 ubiquitin ligases, ARC1, is then activated by SRK in this stigma and cellular events downstream of this cause SI pollen rejection by inhibiting pollen hydration and pollen tube growth. During the transition to selfing, Arabidopsis thaliana lost the SI components, SCR, SRK , and ARC1 . However, this trait can be reintroduced into A. thaliana by adding back functional copies of these genes from closely related SI species. Both SCR and SRK are required for this, though the degree of SI pollen rejection varies between accessions, and ARC1 is not always needed to produce a strong SI response. For A. thaliana C24, only transforming with A. lyrata SCR and SRK confers a strong SI trait, and so here we investigated if ARC1-related PUBs were involved in the SI pathway. Two close ARC1 paralogs, PUB17 and PUB16 , were selected, and CRISPR/Cas9 technology was used to generate pub17 and pub16 mutations in the C24 accession. These mutants were then crossed into a transgenic A. thaliana SI-C24 line and their potential impact on SI pollen rejection was investigated. Overall, we did not observe any significant differences to implicate PUB17 and PUB16 functioning in the transgenic A. thaliana SI-C24 stigma to reject SI pollen.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».