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Enregistrement W4387937011 · doi:10.1101/2023.10.23.563656

A method for sampling parasitized <i>Drosophila suzukii</i> puparia from soil

2023· preprint· en· W4387937011 sur OpenAlexafffundabout
Clarissa Capko, Jason Thiessen, Lana Harach, Jessica Fraser, Michelle T. Franklin, Paul K. Abram

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect behavior and control techniques
Établissements canadiensUniversité LavalAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of the Fraser Valley
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésDrosophila suzukiiBiologyParasitoidParasitismBiological pest controlDrosophila (subgenus)PEST analysisAbundance (ecology)EcologyDrosophilidaeHost (biology)BotanyDrosophila melanogaster

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Methods to measure the diversity and biological control impact of parasitoids for the control of spotted-wing drosophila, Drosophila suzukii (Matsumura) (Diptera: Drosophilidae) are being developed in support of biological control programs around the world. Existing methods to determine parasitism levels and parasitoid species composition focus on sampling D. suzukii within fresh and rotting fruit. However, many D. suzukii pupate in the soil or in dropped fruit, where additional parasitism could occur and where their parasitoids are thought to overwinter. Here we introduce a method for extracting parasitized D. suzukii puparia from the soil through a sieve and flotation system, allowing for effective collection of puparia, from which parasitoids can then be reared. Although the method considerably underestimates the absolute number of puparia in soil samples, it nonetheless yields a high number of puparia relative to sampling effort and provides a robust estimate of the relative abundance of puparia among samples. Using this method, we confirmed that at least five species of parasitoids, including some that have rarely been detected in past studies, overwinter in their immature stages inside D. suzukii puparia in south coastal British Columbia, Canada. The ability to sample puparia from the soil will lead to a more comprehensive view of both D. suzukii and parasitoid abundance throughout the season, help confirm parasitoid establishment following intentional releases, and provide a way to measure the diversity of parasitoid species and potential interactions among parasitoids (e.g., hyper- or klepto-parasitism) that can often occur on the soil surface.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,061
Score d'incertitude au seuil0,122

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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