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Enregistrement W4387940170 · doi:10.12688/wellcomeopenres.20153.1

Cerebrospinal fluid immune cells appear similar across neuropathic and non-neuropathic pain conditions

2023· preprint· en· W4387940170 sur OpenAlexaff
Zoe Hore, Jonathan Royds, Ramla Abuukar Abdullahi, Jon Lampa, Adnan Al‐Kaisy, Franziska Denk

Notice bibliographique

RevueWellcome Open Research · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroinflammation and Neurodegeneration Mechanisms
Établissements canadiensSt. Thomas Hospital
Organismes subventionnairesRosetrees TrustPain Relief FoundationWellcome Trust
Mots-clésNeuropathic painCerebrospinal fluidImmune systemMedicineAnesthesiaImmunologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<ns4:p> Background Microglia have been implicated in the pathophysiology of neuropathic pain. Here, we sought to investigate whether cerebrospinal fluid (CSF) might be used as a proxy-measure of microglial activation in human participants. Methods We preformed fluorescence-activated cell sorting (FACS) of CSF immune cell populations derived from individuals who experienced pain with neuropathic features. We sorted CD4+, CD8+ T cells and monocytes and analyzed their transcriptome using RNA sequencing. We also performed Cellular Indexing of Transcriptomes and Epitopes (CITE) sequencing to characterize the expression of all CSF immune cells in a patient with postherpetic neuralgia and in a patient with neuropathic pain after failed back surgery. Results Immune cell numbers and phenotypes were not obviously different between individuals regardless of the etiology of their pain. This was true when examining our own dataset, as well as when comparing it to previously published single-cell RNA sequencing data of human CSF. In all instances, CSF monocytes showed expression of myeloid cell markers commonly associated with microglia ( <ns4:italic>P2RY12</ns4:italic> , <ns4:italic>TMEM119</ns4:italic> and <ns4:italic>OLFML3</ns4:italic> ), which will make it difficult to ascertain the origin of CSF proteins: do they derive directly from circulating CSF monocytes or could some originate in spinal cord microglia in the parenchyma? Conclusions We conclude that it will not be straightforward to use CSF as a biomarker for microglial function in humans. </ns4:p>

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,020
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies, Communication savante, Science ouverte, Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,070
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0200,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0040,000
Science ouverte0,0040,012
Intégrité de la recherche0,0000,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,195
Tête enseignante GPT0,405
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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