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Enregistrement W4387940270 · doi:10.1007/s10570-023-05551-8

Modularity impacts cellulose surface oxidation by a lytic polysaccharide monooxygenase from Streptomyces coelicolor

2023· article· en· W4387940270 sur OpenAlexafffund
Olanrewaju Raji, Vincent G. H. Eijsink, Emma R. Master, Zarah Forsberg

Notice bibliographique

RevueCellulose · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueAdvanced Cellulose Research Studies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNovo Nordisk FondenNorges ForskningsrådNorges Miljø- og Biovitenskapelige UniversitetGenome CanadaOntario GenomicsNovo Nordisk
Mots-clésCellulosePolysaccharideMonooxygenaseMicrocrystalline celluloseSubstrate (aquarium)ChemistryMaterials scienceChemical engineeringBiophysicsBiochemistryBiologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Lytic polysaccharide monooxygenases (LPMOs) catalyze the oxidation of β-(1,4)-linked polysaccharides, such as cellulose, in a reaction that requires an electron donor and H2O2 as co-substrate. Several LPMOs include a carbohydrate-binding module (CBM), which promotes action on insoluble substrates. Herein, a fluorescent labeling technique was used to track LPMO action on microcrystalline cellulose and evaluate the impact of CBMs on the distribution of LPMO activity across the fiber surface. Confocal microscopic images revealed that the distribution of oxidized positions on the cellulose surface was CBM-dependent: fluorescent spots were concentrated in reactions with a CBM-containing LPMO whereas they were more dispersed for a CBM-deficient LPMO variant. The more dispersed oxidation pattern for the CBM-free LPMO coincided with the release of fewer soluble reaction products.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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