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Enregistrement W4387950168 · doi:10.1126/scitranslmed.adh0353

Immune responses to gut bacteria associated with time to diagnosis and clinical response to T cell–directed therapy for type 1 diabetes prevention

2023· article· en· W4387950168 sur OpenAlexafffund
Quin Xie, Sean Oh, Anthony Wong, Christopher Yau, Kevan C. Herold, Jayne S. Danska

Notice bibliographique

RevueScience Translational Medicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDiabetes and associated disorders
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesBreakthrough T1D Canada
Mots-clésImmune systemImmunologyImmunotherapyMicrobiomeDiseaseMedicineAntibodyType 1 diabetesDiabetes mellitusBiologyInternal medicineBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Immune-targeted therapies have efficacy for treatment of autoinflammatory diseases. For example, treatment with the T cell-specific anti-CD3 antibody teplizumab delayed disease onset in participants at high risk for type 1 diabetes (T1D) in the TrialNet 10 (TN-10) trial. However, heterogeneity in therapeutic responses in TN-10 and other immunotherapy trials identifies gaps in understanding disease progression and treatment responses. The intestinal microbiome is a potential source of biomarkers associated with future T1D diagnosis and responses to immunotherapy. We previously reported that antibody responses to gut commensal bacteria were associated with T1D diagnosis, suggesting that certain antimicrobial immune responses may help predict disease onset. Here, we investigated anticommensal antibody (ACAb) responses against a panel of taxonomically diverse intestinal bacteria species in sera from TN-10 participants before and after teplizumab or placebo treatment. We identified IgG2 responses to three species that were associated with time to T1D diagnosis and with teplizumab treatment responses that delayed disease onset. These antibody responses link human intestinal bacteria with T1D progression, adding predictive value to known T1D risk factors. ACAb analysis provides a new approach to elucidate heterogeneity in responses to immunotherapy and identify individuals who may benefit from teplizumab, recently approved by the U.S. Food and Drug Administration for delaying T1D onset.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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