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Enregistrement W4387956124 · doi:10.1016/j.csbj.2023.10.047

Probiotic responder identification in cross-over trials for constipation using a Bayesian statistical model considering lags between intake and effect periods

2023· article· en· W4387956124 sur OpenAlexfundno aff
Shion Hosoda, Yuichiro Nishimoto, Yohsuke Yamauchi, Takuji Yamada, Michiaki Hamada

Notice bibliographique

RevueComputational and Structural Biotechnology Journal · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGastrointestinal motility and disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceInstitute of GeneticsUniversity of TokyoMinistry of Education, Culture, Sports, Science and Technology
Mots-clésProbioticIdentification (biology)Bayesian probabilityMedicineStatistical analysisStatistical modelStatisticsEconometricsComputer scienceBiologyMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent advances in microbiome research have led to the further development of microbial interventions, such as probiotics and prebiotics, which are potential treatments for constipation. However, the effects of probiotics vary from person to person; therefore, the effectiveness of probiotics needs to be verified for each individual. Individuals showing significant effects of the target probiotic are called responders. A statistical model for the evaluation of responders was proposed in a previous study. However, the previous model does not consider the lag between intake and effect periods of the probiotic. It is expected that the lag exists when probiotics are administered and when they are effective. In this study, we propose a Bayesian statistical model to estimate the probability that a subject is a responder, by considering the lag between intake and effect periods. In synthetic dataset experiments, the proposed model was found to outperform the base model, which did not factor in the lag. Further, we found that the proposed model could distinguish responders showing large uncertainty in terms of the lag between intake and effect periods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,417
Score d'incertitude au seuil0,422

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,076
Tête enseignante GPT0,390
Écart entre enseignants0,314 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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