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Enregistrement W4387962351 · doi:10.1200/op.2023.19.11_suppl.587

Multi-task machine learning of the electronic medical record to predict future symptoms among patients with cancer.

2023· article· en· W4387962351 sur OpenAlexaffabout
Baijiang Yuan, Muammar Kabir, Kevin He, Benjamin Grant, Sharon Narine, Rami Ajaj, Luna Jia Zhan, Aly Fawzy, Janine Xu, Yuhua Zhang, Vivien Yu, Conor French, Wei Xu, Rahul G. Krishnan, Steven Gallinger, Monika K. Krzyzanowska, Tran Truong, Geoffrey Liu, Robert C. Grant

Notice bibliographique

RevueJCO Oncology Practice · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineInterquartile rangeMedical recordMedical diagnosisCohortPsychological interventionElectronic medical recordPhysical therapyInternal medicineEmergency medicineRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

587 Background: Cancer and its treatments often cause symptoms. Automated warning systems could mitigate symptoms by alerting healthcare teams and enabling personalized preventative interventions. We developed a general-purpose longitudinal system for predicting symptomatic deterioration among outpatients undergoing intravenous systemic anti-cancer therapy. Methods: Patients treated for aerodigestive cancers at the Princess Margaret Cancer Centre were randomly divided into development and testing cohorts. For each treatment, machine learning was applied to preceding electronic medical record (EMR) data to predict patient-reported symptom deterioration, defined as at least a four point worsening on the Edmonton Symptom Assessment Scale. Features included diagnostic and treatment characteristics, laboratory tests, and patient-reported symptoms. Single-task (e.g., LASSO and XGboost) and multi-task (e.g., temporal CNNs, LSTM and Transformer) models were trained, tuned, and evaluated based on discrimination, calibration, and net benefit. Results: The cohort consisted of 3,998 patients who underwent 45,904 treatment sessions, with data across 400 features. Among these patients, 1,547 (38.6%) were female; median age was 64.0 (interquartile range 13.0). The most common diagnoses were lung (1,505, 37.6%), head and neck (696, 17.4%), and pancreatic cancers (685, 17.1%). The best model, a multi-task transformer, predicted symptom deterioration with an AUROC range of 0.732-0.822, marking a 1.4-6.2% improvement over the best single-task model. At a 10% alert rate, treatments associated with alerts would be enriched 4-13 fold for symptom deterioration (P<0.001). The system was calibrated and would provide a net benefit across a wide range of threshold probabilities in decision curve analysis. Conclusions: Longitudinal general-purpose multi-task machine learning systems trained using EMR data can accurately predict a wide range of symptoms. Based on these results, automated warning systems for symptoms should be implemented and evaluated in real-time clinical practice to guide preventative interventions.[Table: see text]

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesIntégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,477
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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