MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4387965607 · doi:10.1161/jaha.123.030661

Genome‐Wide Association Study of Pericardial Fat Area in 28 161 UK Biobank Participants

2023· article· en· W4387965607 sur OpenAlexfundno aff
Ahmed Salih, Maddalena Ardissino, Aaron Z. Wagen, Andrew Bard, Liliána Szabó, Mina Ryten, Steffen E. Petersen, André Altmann, Zahra Raisi‐Estabragh

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Heart Association · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiovascular Disease and Adiposity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteCircle Cardiovascular ImagingEuropean CommissionDepartment of Health and Social CareNational Eye InstituteBritish Heart FoundationEngineering and Physical Sciences Research CouncilNational Institute for Health and Care ResearchBarts CharityNational Institute on AgingUK Research and Innovation
Mots-clésMendelian randomizationGenome-wide association studyBiologyBiobankGenetic architectureGenetic associationAdipose tissueGeneticsPhenotypeInternal medicineBioinformaticsGenotypeMedicineGeneEndocrinologySingle-nucleotide polymorphismGenetic variants

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND Pericardial adipose tissue (PAT) is the visceral adipose tissue compartment surrounding the heart. Experimental and observational research has suggested that greater PAT deposition might mediate cardiovascular disease, independent of general or subcutaneous adiposity. We characterize the genetic architecture of adiposity‐adjusted PAT and identify causal associations between PAT and adverse cardiac magnetic resonance imaging measures of cardiac structure and function in 28 161 UK Biobank participants. METHODS AND RESULTS The PAT phenotype was extracted from cardiac magnetic resonance images using an automated image analysis tool previously developed and validated in this cohort. A genome‐wide association study was performed with PAT area set as the phenotype, adjusting for age, sex, and other measures of obesity. Functional mapping and Bayesian colocalization were used to understand the biologic role of identified variants. Mendelian randomization analysis was used to examine potential causal links between genetically determined PAT and cardiac magnetic resonance–derived measures of left ventricular structure and function. We discovered 12 genome‐wide significant variants, with 2 independent sentinel variants (rs6428792, P =4.20×10 −9 and rs11992444, P =1.30×10 −12 ) at 2 distinct genomic loci, that were mapped to 3 potentially causal genes: T‐box transcription factor 15 ( TBX15 ), tryptophanyl tRNA synthetase 2, mitochondrial ( WARS2 ) and early B‐cell factor‐2 ( EBF2 ) through functional annotation. Bayesian colocalization additionally suggested a role of RP4‐712E4.1. Genetically predicted differences in adiposity‐adjusted PAT were causally associated with adverse left ventricular remodeling. CONCLUSIONS This study provides insights into the genetic architecture determining differential PAT deposition, identifies causal links with left structural and functional parameters, and provides novel data about the pathophysiological importance of adiposity distribution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,316

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the American Heart AssociationMême sujetCardiovascular Disease and AdiposityTravaux en français237 207