Identifying the common denominator: Dectin-1 as a promising marker for macrophage modulation in lung cancer and fibrosis
Notice bibliographique
Résumé
Background: Tumor-associated macrophages (TAMs) promote tumorigenesis and tumor growth. They share features with profibrotic macrophages found in lung fibrosis. Identifying specific markers to target these cells in both animal and human models is complex but necessary. This proposal aimed to identify macrophage membrane receptors to link human diseases and animal/cellular models. Methods and Results: To determine a shared gene signature unique to TAMs and profibrotic macrophages, we used transcriptomic datasets of macrophage phenotypes from both human (PBMCs) and murine (bone marrow-derived macrophages) systems obtained from the Gene Expression Omnibus database. To validate the in silico results, we conducted our own macrophage polarizations studies in vitro and utilized nanoString® technology. Through this process, 6 genes were significantly upregulated in profibrotic macrophages and were consistent in both human and murine systems. CLEC7A was one of the identified genes encoding the membrane receptor Dectin-1. In single-cell RNA-seq idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) datasets, CLEC7A was observed to be significantly upregulated in monocytes and macrophages of IPF patients. Similarly, in a lung cancer CosMX spatial dataset, elevated expression of CLEC7A was found in TAMs. Immunohistochemical examination of lung specimens from patients with lung adenocarcinoma and IPF revealed that macrophages infiltrating fibrotic lesions and tumors had increased Dectin-1 levels. Conclusion: Dectin-1 is a macrophage receptor that is upregulated in both murine and human models of lung cancer and IPF serving as a potential therapeutic target to reprogram pathological macrophages.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».