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Enregistrement W4387996386 · doi:10.1038/s41467-023-42230-5

Lactate biosensors for spectrally and spatially multiplexed fluorescence imaging

2023· article· en· W4387996386 sur OpenAlexaff
Yusuke Nasu, Abhi Aggarwal, Giang N. T. Le, Camilla Trang Vo, Yuki Kambe, Xinxing Wang, Felix R. M. Beinlich, Ashley Bomin Lee, Tina Ram, Kelsea A. Gorzo, Yuki Kamijo, Marc Boisvert, Suguru Nishinami, Genki Kawamura, Takeaki Ozawa, H. Toda, Grant R. Gordon, Shaoyu Ge, Hajime Hirase, Maiken Nedergaard, Marie-Ève Paquet, Mikhail Drobizhev, Kaspar Podgorski, Robert E. Campbell

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiquePhotoreceptor and optogenetics research
Établissements canadiensUniversité LavalOccupational Cancer Research CentreUniversity of CalgaryUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesPrecursory Research for Embryonic Science and TechnologyMedical Center, University of RochesterJapan Science and Technology AgencyNational Institutes of HealthH. Lundbeck A/SToyota Physical and Chemical Research InstituteJapan Society for the Promotion of ScienceNovo Nordisk FondenUniversity of RochesterSuntory FoundationNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNovo NordiskPrecise Measurement Technology Promotion FoundationUniversity of TsukubaLundbeckfondenMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologySuntory Foundation for Life SciencesMontana State University
Mots-clésFluorescenceMultiplexingBiosensorFluorescence-lifetime imaging microscopyNanotechnologyOpticsMaterials scienceComputer sciencePhysicsTelecommunications

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

L-Lactate is increasingly appreciated as a key metabolite and signaling molecule in mammals. However, investigations of the inter- and intra-cellular dynamics of L-lactate are currently hampered by the limited selection and performance of L-lactate-specific genetically encoded biosensors. Here we now report a spectrally and functionally orthogonal pair of high-performance genetically encoded biosensors: a green fluorescent extracellular L-lactate biosensor, designated eLACCO2.1, and a red fluorescent intracellular L-lactate biosensor, designated R-iLACCO1. eLACCO2.1 exhibits excellent membrane localization and robust fluorescence response. To the best of our knowledge, R-iLACCO1 and its affinity variants exhibit larger fluorescence responses than any previously reported intracellular L-lactate biosensor. We demonstrate spectrally and spatially multiplexed imaging of L-lactate dynamics by coexpression of eLACCO2.1 and R-iLACCO1 in cultured cells, and in vivo imaging of extracellular and intracellular L-lactate dynamics in mice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,063
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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