“Boundary residues” between the folded RNA recognition motif and disordered RGG domains are critical for FUS–RNA binding
Notice bibliographique
Résumé
Fused in sarcoma (FUS) is an abundant RNA-binding protein, which drives phase separation of cellular condensates and plays multiple roles in RNA regulation. The RNA-binding ability of FUS protein is crucial to its cellular function. Here, our molecular simulation study on the FUS-RNA complex provides atomic resolution insights into the observations from biochemical studies and also illuminates our understanding of molecular driving forces that mediate the structure, stability, and interaction of the RNA recognition motif (RRM) and RGG domains of FUS with a stem-loop junction RNA. We observe clear cooperativity and division of labor among the ordered (RRM) and disordered domains (RGG1 and RGG2) of FUS that leads to an organized and tighter RNA binding. Irrespective of the length of RGG2, the RGG2-RNA interaction is confined to the stem-loop junction and the proximal stem regions. On the other hand, the RGG1 interactions are primarily with the longer RNA stem. We find that the C terminus of RRM, which make up the "boundary residues" that connect the folded RRM with the long disordered RGG2 stretch of the protein, plays a critical role in FUS-RNA binding. Our study provides high-resolution molecular insights into the FUS-RNA interactions and forms the basis for understanding the molecular origins of full-length FUS interaction with RNA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».