Saccharomycopsis praedatoria sp. nov., a predacious yeast isolated from soil and rotten wood in an Amazonian rainforest biome
Notice bibliographique
Résumé
Three yeast isolates were obtained from soil and rotting wood samples collected in an Amazonian rainforest biome in Brazil. Comparison of the intergenic spacer 5.8S region and the D1/D2 domains of the large subunit rRNA gene showed that the isolates represent a novel species of the genus Saccharomycopsis . A tree inferred from the D1/D2 sequences placed the novel species near a subclade containing Saccharomycopsis lassenensis , Saccharomycopsis fermentans , Saccharomycopsis javanensis , Saccharomycopsis babjevae , Saccharomycopsis schoenii and Saccharomycopsis oosterbeekiorum , but with low bootstrap support. In terms of sequence divergence, the novel species had the highest identity in the D1/D2 domains with Saccharomycopsis capsularis , from which it differed by 36 substitutions. In contrast, a phylogenomic analysis based on 1061 single-copy orthologs for a smaller set of Saccharomycopsis species whose whole genome sequences are available indicated that the novel species represented by strain UFMG-CM-Y6991 is phylogenetically closer to Saccharomycopsis fodiens and Saccharomycopsis sp. TF2021a (= Saccharomycopsis phalluae ). The novel yeast is homothallic and produces asci with one spheroidal ascospore with an equatorial or subequatorial ledge. The name Saccharomycopsis praedatoria sp. nov. is proposed to accommodate the novel species. The holotype of Saccharomycopsis praedatoria is CBS 16589 T . The MycoBank number is MB849369. S. praedatoria was able to kill cells of Saccharomyces cerevisiae by means of penetration with infection pegs, a trait common to most species of Saccharomycopsis .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».