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Enregistrement W4388079573 · doi:10.1016/j.pnpbp.2023.110888

SETD1A variant-associated psychosis: A systematic review of the clinical literature and description of two new cases

2023· review· en· W4388079573 sur OpenAlexaff
Mark Ainsley Colijn, Prescilla Carrion, Guillaume Poirier‐Morency, Sanja Rogić, Ivan J. Torres, Mahesh Menon, Michelle Lisonek, Courtney B. Cook, Ashley DeGraaf, Subramanya Ponnachana Thammaiah, Veerle Willaeys, Olga Leonova, Randall F. White, Stephen Yip, Andrew J. Mungall, Patrick MacLeod, William T. Gibson, Patrick F. Sullivan, William G. Honer, Paul Pavlidis, Robert Stowe

Notice bibliographique

RevueProgress in Neuro-Psychopharmacology and Biological Psychiatry · 2023
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensBC Children's HospitalFraser HealthSt. Paul's HospitalProvidence Health CareCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreBC Mental Health & Substance Use ServicesUniversity of British ColumbiaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPsychosisSchizophrenia (object-oriented programming)BiologyDiseasePhenotypePsychiatryGeneticsMedicineGenePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: SETD1A encodes a histone methyltransferase involved in various cell cycle regulatory processes. Loss-of-function SETD1A variants have been associated with numerous neurodevelopmental phenotypes, including intellectual disability and schizophrenia. While the association between rare coding variants in SETD1A and schizophrenia has achieved genome-wide significance by rare variant burden testing, only a few studies have described the psychiatric phenomenology of such individuals in detail. This systematic review and case report aims to characterize the neurodevelopmental and psychiatric phenotypes of SETD1A variant-associated schizophrenia. METHODS: A PubMed search was completed in July 2022 and updated in May 2023. Only studies that reported individuals with a SETD1A variant as well as a primary psychotic disorder were ultimately included. Additionally, another two previously unpublished cases of SETD1A variant-associated psychosis from our own sequencing cohort are described. RESULTS: The search yielded 32 articles. While 15 articles met inclusion criteria, only five provided case descriptions. In total, phenotypic information was available for 11 individuals, in addition to our own two unpublished cases. Our findings suggest that although individuals with SETD1A variant-associated schizophrenia may share a number of common features, phenotypic variability nonetheless exists. Moreover, although such individuals may exhibit numerous other neurodevelopmental features suggestive of the syndrome, their psychiatric presentations appear to be similar to those of general schizophrenia populations. CONCLUSIONS: Loss-of-function SETD1A variants may underlie the development of psychosis in a small percentage of individuals with schizophrenia. Identifying such individuals may become increasingly important, given the potential for advances in precision medicine treatment approaches.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0150,018
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,407
Écart entre enseignants0,340 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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