1040-D Identification of four clinically-relevant immunomodulatory programs shared across nearly all glioma-associated myeloid cells
Notice bibliographique
Résumé
Background Gliomas are incurable malignancies notable for an immunosuppressive microenvironment with abundant myeloid cells whose immunomodulatory properties remain poorly defined. Methods We utilize scRNA-seq data for 183,062 myeloid cells from 85 human tumors and integrate mitochondrial DNA-based lineage tracing, spatial transcriptomics, and functional organoid models. Results We discover that nearly all glioma-associated myeloid cells express at least one of four immunomodulatory activity programs. These include a Scavenger Immunosuppressive program, a C1Q Immunosuppressive program, a CXCR4 Inflammatory program, and an IL1B inflammatory program. We reveal that these programs are driven by microenvironmental cues and therapies rather than myeloid cell type or origin. All four programs are present in lower-grade and high-grade gliomas and expressed in multiple myeloid cell types derived from blood or resident myeloid cell origins. The Scavenger Immunosuppressive program is induced in hypoxic regions, while the C1Q Immunosuppressive program is driven by dexamethasone. Both immunosuppressive programs are less prevalent in lower-grade gliomas, which are instead enriched for the CXCR4 Inflammatory program. We validated this striking myeloid cell plasticity by demonstrating that application of peripheral blood monocytes to glioma organoid models leads to de novo induction of microglia, macrophage and dendritic cell identities, and all four immunomodulatory programs. Conclusions Our study provides a resource and new framework to understand immunomodulatory myeloid cells in glioma, and a foundation to develop effective immunotherapy strategies for glioma patients. Ethics Approval All work with human subjects was approved by the Dana Farber Cancer Institute’s Institutional Review Board under the protocol 10-417.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,010 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».