Genetic diversity of the Rhododendron subsection Ledum species in Sakhalin Island: data from chloroplast DNA markers variability
Notice bibliographique
Résumé
A high genetic variability was revealed in the populations of the Rhododendron subsection Ledum species complex in Sakhalin. In total, 94 individuals from natural populations of the four sympatric species of Labrador tea (R. tomentosum, R. subarcticum, R. tolmachevii and R. hypoleucum) were analyzed to evaluate the genetic variation in the territory of the Sakhalin Island and in two mainland populations. The haplotype diversity of five chloroplast intergenic spacers (trnH–psbA, petB–petD, 3’trnV (UAC)–ndhC, K2R–K707, atpB–rbcL) was quite high. There were 16 haplotypes (h1–h16) identified; h1, h2 and h4 are the most common, the rest were rare and no species-specific ones were found. Analysis of Molecular Variance (AMOVA) indicate that about 37 % of the genetic diversity is due to among population differences (FST = 0.37, p < 0.001). Molecular phylogenetic analysis based on chloroplast DNA data did not reveal a clear species structure, but revealed a trend towards the isolation of two genetic groups: including a group of samples from the southern and the middle parts of Sakhalin Island.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».